Emblème du ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche scientifiqueRépublique Algérienne Démocratique et Populaire · Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique

Biologie criminalistique

Appliquer les sciences biologiques à l’analyse des indices.

DiplômeIngénieur d’État
DuréeSecond cycle · trois ans

Analyse de traces biologiques, empreinte génétique, sérologie, identification génétique et interprétation scientifique des éléments biologiques dans un contexte judiciaire.

Biologie criminalistique — illustration des sciences de l’identification et de l’analyse
Biologie criminalistique — illustration des sciences de l’identification et de l’analyse
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Responsable de spécialité

Dr Lamia Lablack

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Département

Département du Second Cycle

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Objectifs de la formation

Appliquer les sciences biologiques à l’étude des éléments biologiques dans un contexte criminalistique. Associer connaissances moléculaires, analyse des traces et interprétation rigoureuse des données, dans le respect des exigences éthiques et de traçabilité.

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Disciplines et enseignements

Génétique et biologie moléculaire appliquées aux traces biologiques, toxicologie, microbiologie, entomologie, botanique et chimie analytique dans leurs applications criminalistiques.

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Compétences développées

Mobiliser la biologie moléculaire, la génétique, la biochimie et la microbiologie ; analyser des profils génétiques et des traces biologiques ; évaluer la portée et les limites des résultats. Comprendre la chaîne de conservation des éléments analysés, les principes de qualité et la communication des conclusions scientifiques.

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Domaines d’application

Analyse des traces biologiques, identification génétique, sérologie, qualité et traçabilité des analyses.

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Organisation et pratique

Formation pratique, études de cas, visites pédagogiques et découverte de plateformes d’analyse. L’interprétation scientifique et l’éthique accompagnent l’apprentissage technique.

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Stages

Stages en laboratoire de recherche ou en entreprise.

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Projet de fin d’études

Projet mobilisant les acquis scientifiques et pratiques.

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Perspectives professionnelles

Analyse biologique et contrôle qualité, biotechnologies, recherche et développement, et activités d’expertise selon les conditions de recrutement et d’exercice applicables. Le parcours prépare aussi à la poursuite d’études et à la conception de projets innovants ; il ne confère pas automatiquement un statut d’expert judiciaire.

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Doctorat et recherche

La formation prépare à la recherche et à une candidature en doctorat selon les conditions d’accès et les offres ouvertes. À l’ESSBO, les formations doctorales en Biotechnologie et Santé et en Biotechnologie Microbienne prolongent l’environnement scientifique des sciences biologiques.

Maquette pédagogique · 2026

Votre parcours, semestre par semestre

47 matières affichées

Semestre 19 matières
  1. Fondements de la biologie criminalistique
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 70h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S1
    Fondements de la biologie criminalistique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    En Biologie cellulaire et moléculaire, Génétique, Microbiologie, Biochimie, Méthodes d'analyse et techniques de laboratoire

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    À la fin du cours de biologie criminalistique, les étudiants auront acquis une compréhension approfondie des applications biologiques dans le domaine de la criminalistique. Ils seront capables de mettre en pratique les techniques d'analyse biologique pour examiner les preuves sur les scènes de crime, d'interpréter les résultats obtenus, et de les présenter de manière pertinente dans le cadre d'enquêtes criminelles. En outre, ils seront sensibilisés aux implications éthiques et légales associées à l'utilisation de preuves biologiques dans le système judiciaire.

    Programme

    Contenu de la matière

    1. Introduction à la criminalistique biologique

    Historique et évolution de la biologie criminalistique

    Les pionniers de la criminalistique biologique

    Les grandes avancées technologiques et scientifiques dans le domaine

    Importance et applications dans les enquêtes criminelles

    Rôle de la biologie dans la résolution des crimes

    Exemples d'affaires célèbres résolues grâce à la biologie criminalistique

    Éthique et normes professionnelles

    Principes éthiques dans la collecte et l'analyse des preuves biologiques

    Respect de la vie privée et des droits individuels

    Techniques d'analyse biologique

    Prélèvement, conservation et traitement des échantillons biologiques

    Méthodes de prélèvement sur la scène de crime

    Protocoles de conservation des échantillons pour une analyse ultérieure

    Analyse d'ADN

    Principes de la PCR, de l'électrophorèse et du séquençage de l'ADN

    Applications de l'analyse d'ADN dans les enquêtes criminelles

    Analyse des fluides corporels

    Méthodes d'identification et de caractérisation des fluides biologiques

    Techniques pour différencier les différents types de fluides (sang, salive, sperme, urine)

    Identification des fibres, cheveux et autres traces biologiques

    Utilisation de techniques microscopiques et chimiques pour l'identification des fibres et des cheveux

    Importance des traces biologiques dans la reconstruction des événements criminels

    Interprétation des preuves biologiques

    Évaluation

    Évaluation et comparaison des profils d'ADN

    Méthodes pour évaluer la similarité entre les profils d'ADN

    Utilisation des bases de données génétiques pour l'identification des suspects

    Analyse de la scène de crime pour récupérer des preuves biologiques

    Techniques de recherche et de collecte des preuves biologiques sur la scène de crime

    Protocoles pour éviter la contamination et préserver l'intégrité des échantillons

    Applications spécialisées

    Étude des insectes nécrophages en entomologie forensique

    Rôle des insectes dans la détermination du moment de la mort

    Méthodes pour collecter et analyser les insectes sur une scène de crime

    Analyse des micro-organismes dans les cas de bioterrorisme

    Détection et identification des agents pathogènes dans les échantillons biologiques

    Techniques pour évaluer la menace biologique et prévenir les attaques

    Détection et analyse de toxines et de substances illicites dans les échantillons biologiques

    Méthodes de détection des toxines et des drogues dans les échantillons biologiques

    Utilisation de la chromatographie et de la spectrométrie de masse pour l'analyse des substances illicites

    Études de cas et travaux pratiques

    Analyse de scénarios de crime simulés

    Mise en pratique des techniques d'analyse biologique sur des scènes de crime simulées

    Interprétation des preuves et résolution des enquêtes fictives

    Utilisation de techniques d'analyse biologique sur des échantillons réels

    Travaux pratiques en laboratoire pour mettre en œuvre les techniques d'analyse biologique

    Interprétation des résultats et rédaction de rapports d'expertise

    Rapports d'expertise et témoignages d'experts en cours

    Rédaction de rapports d'expertise basés sur les résultats des analyses biologiques

    Préparation et présentation des témoignages d'experts en cour de justice.

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  2. Anatomie et physiologie humaine 1
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S1
    Anatomie et physiologie humaine 1

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Il est nécessaire d’avoir des connaissances de base en biologie générale, notamment sur la structure et les fonctions des cellules, ainsi qu’une maîtrise élémentaire du vocabulaire scientifique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Le module vise à fournir aux étudiants les bases essentielles sur la structure du corps humain, incluant l’anatomie des muscles, des os, des articulations, ainsi que l’organisation des systèmes nerveux et circulatoire. Il permet également de maîtriser le vocabulaire anatomique et les notions fondamentales nécessaires à la compréhension des fonctions physiologiques.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Introduction à l’anatomie et à la physiologie

    Définitions et différences entre anatomie et physiologie

    Terminologie anatomique : plans, axes, positions

    Organisation hiérarchique du corps humain : atomes, molécules, cellules, tissus, organes, systèmes

    Concepts d’homéostasie et de régulation physiologique

    Chapitre 2 : La cellule et les tissus

    Structure et fonction de la cellule humaine

    Organites cellulaires essentiels

    Types de tissus : épithélial, conjonctif, musculaire, nerveux

    Rôle fonctionnel de chaque tissu dans l’organisme

    Chapitre 3 : Le système tégumentaire

    Structure de la peau : épiderme, derme, hypoderme

    Annexes cutanées : poils, ongles, glandes sudoripares et sébacées

    Fonctions principales de la peau

    Chapitre 4 : Le système squelettique

    Classification des os : longs, courts, plats, irréguliers

    Anatomie des os : composition, structure microscopique

    Les principales articulations : types et mouvements

    Introduction à la myologie : types de muscles (striés, lisses, cardiaques)

    Chapitre 5 : Le système musculaire

    Anatomie macroscopique des muscles squelettiques

    Mécanismes de contraction musculaire

    Rôle des muscles dans le mouvement et la posture

    Chapitre 6 : Le système nerveux (introduction)

    Organisation générale : système nerveux central et périphérique

    Neurones et cellules gliales : structure et fonction

    Transmission de l’influx nerveux

    Chapitre 7 : Les organes des sens

    Structure et fonction de l’œil

    Anatomie de l’oreille et mécanismes de l’audition

    Sens du goût et de l’odorat

    Chapitre 8 : Introduction aux systèmes digestif et urinaire

    Anatomie générale du tube digestif

    Fonctions principales

    Anatomie et rôle des reins dans l’homéostasie

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  3. Biologie Moléculaire 1
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S1
    Biologie Moléculaire 1

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    En biologie cellulaire, en biochimie et en génétique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Les étudiants devraient être capables d'acquérir des connaissances de base sur la structure et les propriétés des acides nucléiques et comprendre l’organisation des génomes et des gènes chez les procaryotes et les eucaryotes. L’objectif de cette matière est aussi d'apprendre les divers événements moléculaires impliqués dans la réplication et la transcription de l’ADN, ainsi que la traduction de l’ARN messager. Les mécanismes par lesquels l'ADN pourrait être endommagé et réparé y seront également détaillés.

    Les étudiants seront également sensibilisés à l’intégration de l’intelligence artificielle (IA) en biologie moléculaire, afin de développer des compétences en analyse de données biologiques et encourager une approche interdisciplinaire innovante.

    Programme

    Contenu de la matière :

    Introduction à la biologie moléculaire

    Définition

    Historique

    Dogme central de la biologie moléculaire

    Structure des acides nucléiques

    1. Les composants chimiques des acides nucléiques

    1.1. Les bases azotées

    1.2. Les pentoses

    1.3. Le groupement phosphate

    2. Nucléosides, nucléotides

    2.1. Liaison N-glycosidique et les différents nucléosides générés

    2.2. Liaison phosphoester

    2.3. Liaison pyrophosphate

    2.4. Nomenclature

    3. Polymérisation des nucléotides

    3.1. Liaison phosphodiester et formation des polymères nucléotidiques

    3.2. Conventions d’écriture

    4. L’acide désoxyribonucléique (ADN)

    4.1. Structure de l’ADN

    4.2. Caractéristiques de la double hélice

    4.3. Propriétés physico-chimiques de l’ADN

    4.4. Structure tridimensionnelle (compaction), suprastructure.

    5. Les acides ribonucléiques (ARN)

    5.1. Structure et caractéristiques acides ribonucléiques

    5.2. Les différents types d’acides ribonucléiques : synthèse et fonction

    6. Manipulation des acides nucléiques

    Exonucléases, endonucléases de restriction.

    Organisation des génomes et des gènes

    Définitions

    Organisation des génomes

    2. 1 Contenu des génomes

    2. 2 Variabilité des génomes

    2. 3 Ressemblance entre génomes

    2. 4 Génome des procaryotes

    ADN chromosomique

    ADN extrachromosomique : les plasmides

    2. 5 Génome des eucaryotes

    Hétérogénéité des séquences d’ADN

    ADN hautement répété

    ADN moyennement répété

    ADN non répété

    ADN mitochondrial

    2. 6 Plasticité des génomes et éléments transposables

    Organisation des gènes

    3. 1 Chez les procaryotes

    3. 2 Chez les eucaryotes

    3. 3 Différents types de gènes

    Gènes à copie unique ; gènes de structure, gènes de régulation, pseudogènes et gènes de ménage.

    Familles et superfamilles de gènes (homologues, paralogues, orthologues, xénologues)

    Réplication de l’ADN

    Généralités

    Lois fondamentales de la réplication

    2. 1. Réplication semi-conservative

    2. 2. Origine de réplication

    2. 3. Réplication bidirectionnelle

    2. 4. Polymérisation unidirectionnelle

    2. 5. Réplication semi-discontinue

    2. 6. Amorce d’ARN (primer)

    Les enzymes de la réplication

    3. 1. Les hélicases

    3. 2. Les topoisomérases

    3. 3. La primase

    3. 4. Les ADN polymérases

    3. 5. L’ADN ligase

    Les protéines de la réplication

    La réplication chez les procaryotes

    5. 1. Les différentes protéines mise en jeu

    5. 2. Origines et terminaisons chez E-Coli

    5. 3. Les étapes de la réplication procaryote

    5. 4. Régulation de la réplication chez E-Coli

    La réplication chez les eucaryotes

    6. 1. Les ADN polymérases eucaryotes

    6. 2. Les télomères et les télomérases

    Histones et réplication

    La réplication du matériel génétique des rétrovirus

    Variations et maintenance du matériel génétique

    Introduction

    Lésions de l’ADN

    Lésions endogènes

    Erreurs de réplication

    Tautomérisation

    Dépurinations et dépyrimidations

    Désaminations

    Erreurs de méthylations

    Lésions provoquées par des agents exogènes

    Les lésions dues à des mutagènes physiques

    Les lésions dues à des mutagènes chimiques

    Prévention

    Réponses cellulaires aux lésions de l’ADN

    Réparation de l’ADN

    Réparation immédiate

    Réparation durant la réplication

    Inversion directe photolyases

    Inversion directe par alkyl transférases

    Réparation secondaire

    Réparation par excision de base (BER)

    Réparation par excision de nucléotide (NER)

    Réparation des mésappariements

    Réparation des cassures par la recombinaison

    Système SOS chez E. coli

    Déficience de systèmes de réparation (quelques exemples)

    Variations génétiques

    Types de mutations ponctuelles

    Selon la nature de la mutation

    Mutation par substitution ; Mutation par délétion ; Mutation par addition

    Selon la conséquence de la mutation

    Mutation faux sens ; Mutation non-sens ; Mutation silencieuse ; Mutation Frameshift

    Transcription de l’ADN

    Généralités

    L’unité de transcription

    Notion de brin matrice et brin codant

    Transcription chez les procaryotes

    Initiation

    Elongation

    Terminaison

    Terminaison rho-dépendante

    Terminaison rho-indépendante

    Maturation des transcrits primaires

    Transcription chez les eucaryotes

    Différence dans la transcription eucaryote

    Les ARN-polymérases eucaryotes

    Complexe protéique nécessaire à la transcription

    Promoteurs eucaryotes

    Initiation

    Elongation

    Terminaison

    Maturation post-transcriptionnelle de l’ARNm chez les eucaryotes

    Le coiffage

    La poly-adénylation

    Epissage

    Traduction

    Le code génétique

    Les acteurs de la traduction

    2.1. Les ribosomes (synthèse, structure et fonction)

    2.2. Les ARNt (structure et rôle) et les aminoacyl-ARNt synthétases

    Structure des ARNt et ARNt iso-accepteur

    Chargement de l’acide aminé sur l’ARNt

    Les différentes étapes de la traduction procaryote

    3.1. Initiation

    3.2. Elongation

    a. Réaction de couplage

    b. Formation de la liaison peptidique et libération du premier ARNt

    c. Translocation

    3.3. Terminaison

    Les spécificités de la traduction eucaryote

    Modifications post-traductionnelles

    Définitions et exemples

    La phosphorylation

    L’acétylation et la méthylation des histones

    Acétylation de p53

    Introduction aux applications de l’intelligence artificielle (IA) en biologie moléculaire

    Définition de l’IA et concepts clés (algorithmes, machine learning, deep learning)

    Introduction aux bases de données biologiques (NCBI, Ensembl, UniProt)

    Introduction aux outils : BLAST, Clustal Omega, AlphaFold

    Introduction à l’utilisation de l’IA pour l’analyse des séquences ADN/ARN : alignement multiple, prédiction des structures secondaires

    Introduction aux outils informatiques et d’IA utilisés pour l’annotation automatique des génomes (ex. : DeepGene, GeneMark)

    IA pour la prédiction des promoteurs et d’épissage alternatif

    Modélisation des structures protéiques, prédiction des sites actifs, simulation de la traduction.

    Travaux dirigés :

    Fiche TD 01 : Structure des acides nucléiques

    Fiche TD 02 : Organisation des génomes et des gènes

    Fiche TD 03 : Réplication de l’ADN

    Fiche TD 04 : Variations et maintenance du matériel génétique

    Fiche TD 05 : Transcription de l’ADN

    Fiche TD 06 : Traduction de l’ARN messager

    Fiche TD 07 : Applications de l’IA en biologie moléculaire :

    Introduction aux bases de données biologiques, aux outils bioinformatiques et à l’IA (BLAST, Ensembl, AlphaFold)

    Classer des séquences par similarité

    Utiliser un outil simple d’alignement avec IA

    Démonstration de base d’un algorithme d’apprentissage supervisé (ex : arbre de décision pour classer des mutations comme bénignes ou pathogènes)

    Prédiction de structure d’ARN et de protéine avec outils IA accessibles en ligne

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  4. Chimie analytique 1
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S1
    Chimie analytique 1

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en chimie générale et en chimie organique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Acquérir les connaissances théoriques et pratiques nécessaires pour comprendre les principes et les techniques de base utilisés en chimie analytique, ainsi que leur application dans divers domaines scientifiques et industriels.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction à la Chimie Analytique

    Définitions et concepts de base en chimie analytique.

    Classification des méthodes analytiques et leurs applications dans différents domaines.

    Importance de la précision, de la sensibilité et de la sélectivité dans les analyses chimiques.

    Chimie des Solutions

    Théorie des solutions : concentrations massiques, molaires et molaire molale.

    Influence des facteurs tels que la température, la pression et le pH sur les réactions en solution.

    Techniques de préparation des solutions, de dilution et de normalisation.

    Équilibres Chimiques

    Principes des équilibres chimiques : produit de solubilité, constante d'acidité et de basicité.

    Facteurs influençant les équilibres chimiques et leur déplacement.

    Application des équilibres chimiques dans les réactions de précipitation et de complexation.

    Analyse Volumétrique

    Techniques de titrage : titrage acido-basique, titrage oxydoréducteur, titrage complexométrique.

    Utilisation des indicateurs colorés et des méthodes de détection des points d'équivalence.

    Calculs de concentrations et de volumes équivalents.

    Analyse Instrumentale

    Introduction aux techniques d'analyse instrumentale : spectroscopie, chromatographie, électrochimie.

    Principes de fonctionnement des instruments analytiques modernes et applications dans les analyses chimiques.

    Chromatographie

    Principes de la chromatographie en phase liquide (HPLC) et en phase gazeuse (GC).

    Séparation des composés en fonction de leurs interactions avec la phase stationnaire.

    Interprétation des chromatogrammes et quantification des analytes.

    Spectroscopie

    Principes de la spectroscopie UV-Vis, IR et RMN.

    Interaction de la lumière avec la matière et information fournie par les spectres.

    Utilisation de la spectroscopie pour l'identification qualitative et la quantification des composés.

    Électrochimie

    Principes de l'électrochimie et des techniques électrochimiques telles que la voltamétrie et la polarographie.

    Mesure des grandeurs électrochimiques et applications dans l'analyse de substances chimiques.

    Traitement des Données Analytiques

    Méthodes statistiques pour l'analyse des données : moyennes, écarts-types, intervalles de confiance.

    Évaluation

    Évaluation de la fiabilité des résultats d'analyse, estimation des incertitudes et rédaction de rapports analytiques.

    Applications de la Chimie Analytique

    Utilisation de la chimie analytique dans divers domaines : contrôle de qualité dans l'industrie, surveillance de l'environnement, analyse des aliments et des médicaments, etc.

    Développements récents et perspectives futures dans le domaine de la chimie analytique.

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc
  5. Atelier de Biologie Moléculaire
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 60h00
    Cours / semaine: TD / semaine: TP / semaine: 04h00Autres heures: 60h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

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    S1
    Atelier de Biologie Moléculaire

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    En biologie moléculaire, génétique et biochimie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L'objectif de cet atelier est d'initier les étudiants aux techniques de base en biologie moléculaire et aux bons gestes lors de la manipulation du matériel génétique et les outils moléculaires.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 : Atelier d’extraction d’ADN génomique

    Extraction de l’ADN génomique à partir

    Sang

    Salive

    Sperme

    Cheveux

    Peau

    Dents : Os

    Autres types d’échantillons

    D’un tissu animal

    D’un tissu végétal

    De bactéries : gram + et gram -

    De champignons

    De virus

    Atelier 2 : Atelier d’extraction d’ARN

    Atelier 3 : Atelier de dosage, de contrôle de qualité et de séparation des acides nucléiques

    Dosage des acides nucléiques par spectrophotométrie

    Electrophorèse sur gel d’agarose

    Atelier 4 : Atelier de PCR (Polymerase Chain Reaction)

    PCR STR

    PCR en temps réel et quantitative

    RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Compte rendu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  6. Atelier de Chimie Analytique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: TD / semaine: TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

    Explorer la matière
    S1
    Atelier de Chimie Analytique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Connaissances en chimie générale, Compréhension des principes de base de la spectroscopie et de la chromatographie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cet atelier vise à former les étudiants à la maîtrise opérationnelle des outils clés de la chimie analytique moderne : de la mesure de signaux électriques en électrochimie (potentiométrie, voltamétrie, coulométrie) à l’analyse spectroscopique (UV-Vis, IR), en passant par les séparations chromatographiques (HPLC, GC) et la détection structurale par spectrométrie de masse, tout en assurant la fiabilité des données via des protocoles de validation conformes à la norme ISO 17025.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 : Electrochimie et Méthodes Électroanalytiques

    Atelier 2 : Spectroscopie UV-Vis et IR

    Atelier 3 : Chromatographie en Phase Liquide (HPLC)

    Atelier 4 : Spectrométrie de Masse (MS)

    Atelier 5 : Méthodes de Validation et Assurance Qualité

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Compte rendu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  7. Infraction et Répression en Sciences Forensiques
    2 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: Autres heures: 25h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S1
    Infraction et Répression en Sciences Forensiques

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Une bonne connaissance du droit civil I et du droit constitutionnel, ainsi que la familiarité avec la méthodologie juridique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module vise à fournir aux étudiant·e·s une compréhension approfondie des principes généraux du droit pénal (légalité des infractions, éléments constitutifs, responsabilités) et de la procédure pénale (enquête, instruction, jugement et voies de recours), en les préparant à analyser des cas jurisprudentiels et à maîtriser le vocabulaire juridique fondamental

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Introduction générale au droit pénal

    Définition et objet du droit pénal

    Fonctions du droit pénal

    Sources du droit pénal

    Principes fondamentaux

    Lien avec la criminalistique

    Chapitre 2 : Les infractions pénales

    Classification des infractions

    Éléments constitutifs de l’infraction

    Élément légal : l’acte doit être interdit par la loi.

    Élément matériel : acte ou omission matériellement constaté.

    Élément moral : intention coupable ou faute.

    La tentative et la complicité

    Responsabilité pénale

    Lien avec la biologie criminalistique

    Chapitre 3 : Les sanctions pénales

    Typologie des peines

    Objectifs des sanctions

    Exécution et prescription des peines

    Chapitre 4 : Introduction à la procédure pénale

    Définition et finalité

    Principes fondamentaux

    Les acteurs de la procédure

    Lien avec la criminalistique

    Le rôle clé des experts en biologie criminalistique dans la phase d’enquête et d’instruction.

    Chapitre 5 : Les étapes de la procédure pénale

    Enquête préliminaire

    Instruction préparatoire

    Jugement

    Voies de recours

    Chapitre 6 : La preuve pénale et le rôle de l’expert en biologie criminalistique (aspects théoriques)

    Notion et importance de la preuve en droit pénal

    Modes de preuve

    Rôle de l’expert en biologie criminalistique

    Identification et collecte des traces biologiques (sang, sperme, salive, cheveux).

    Respect de la chaîne de conservation des preuves pour garantir leur intégrité.

    Analyse ADN et typage génétique pour individualisation.

    Rédaction de rapports d’expertise et témoignage en justice.

    Lien avec la procédure pénale

    Chapitre 7 : Droits des victimes et de la défense

    Droits fondamentaux des victimes

    Droits de la défense

    Évaluation

    Mode d’évaluation

    Contrôle continu : 40% (exposés, analyses de cas criminels, quizz)

    Examen final : 60% (questions de réflexion et études de cas)

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  8. Stratégies de Recherche et Communication Scientifique
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: TP / semaine: Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S1
    Stratégies de Recherche et Communication Scientifique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Français, anglais, outil informatique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module a pour objectif d’initier les étudiants aux différentes sources d'information en biologie et en biotechnologie, de leur faire maîtriser les outils et stratégies de la recherche scientifique, ainsi que de les sensibiliser aux pratiques de rédaction scientifique adaptées aux sciences appliquées et à l’ingénierie. Il vise également à développer chez eux une compréhension des différentes situations de communication scientifique, à leur permettre de maîtriser les processus et supports de communication scientifique (articles, communications orales, posters) et à les familiariser avec les principes de l’open science ainsi qu’avec la communication de la science vers le grand public.

    Programme

    Contenu de la matière

    Partie 1 : Recherche Documentaire et Rédaction Scientifique

    Introduction à la recherche scientifique

    Typologie des documents et littérature scientifique

    Évolution des méthodes de recherche

    Science ouverte et accès libre

    Méthodologie de recherche : Approches avancées

    Définition de la question d’étude (Méthodes PICO, 3QPOC)

    Sélection des outils de recherche : Catalogues, bases de données pluridisciplinaires et Spécialisées

    Utilisation des moteurs de recherche spécialisés et plateformes de texte intégral

    Optimisation et exploitation des résultats de recherche

    Analyse de la pertinence des sources

    Fiabilité, actualité et exactitude des informations

    Gestion des références et utilisation des gestionnaires bibliographiques (EndNote, Zotero, Mendeley)

    Rédaction scientifique moderne

    Analyse d’articles et élaboration de rapports

    Rédaction d’un mémoire de fin d’études

    Rédaction d’articles et communications scientifiques

    Partie 2 : Communication Scientifique et Diffusion des Connaissances

    Les enjeux de la communication scientifique

    Pourquoi et comment communiquer la science ?

    Stratégies et techniques modernes d’expression écrite et orale

    Interactions et échanges scientifiques en milieu académique

    Fonctionnement des échanges scientifiques

    Présentation et valorisation de ses recherches

    Utilisation des outils numériques pour la visibilité

    Open Science et vulgarisation scientifique

    Stratégies de diffusion vers le grand public

    Utilisation des médias numériques et des nouvelles technologies

    Interaction avec la presse et les médias

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  9. English for Biologists - Starter
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: TP / semaine: Autres heures: 05h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S1
    English for Biologists - Starter

    Repères

    Connaissances préalables recommandées
    Prior knowledge of basic English

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    This course aims to help students build strong skills in speaking and writing in English.

    Programme

    Contenu de la matière

    Unit 1: Tell us about yourself

    Grammar: Tenses (present, past, future). Question forms (where, what, who, why, how much).

    Vocabulary: words with more than one meaning.

    Reading: Cell communication.

    Speaking: students of ESSBO talking about each other.

    Listening: Listening to a scientist speaking about his/her career.

    Writing: Informal letter.

    Unit 2: The way we live

    Grammar: Present tenses: present simple, present continuous.

    Vocabulary: At the laboratory.

    Reading: Living in Oran.

    Speaking: Share with us your experience about living on campus.

    Listening: Student life at other universities.

    Writing: Transition (linking words).

    Unit 3: Biologist from the past

    Grammar: Past tenses: past simple, past continuous.

    Vocabulary: Time expressions.

    Reading: DNA fingerprinting in forensic science

    Speaking: Telling the story of a scientific discovery or famous criminal case involving biology

    Listening: Rosalind Franklin and the discovery of DNA

    Writing: write a short story about your favourite scientist.

    Unit 4: Let’s explore the biology lab

    Grammar: Much / Many, Some / Any

    Vocabulary: Laboratory tools and biological products

    Reading: Scientific supply chains – from biomolecules to lab benches

    Speaking: Talking about materials and substances used in the lab

    Listening: Visiting a forensic biology lab – what do scientists need?

    Writing: Write a short paragraph describing essential biomolecules used in DNA analysis or other forensic tests

    Unit 5: What do you want to do?

    Grammar: Verb patterns, Expressing intentions

    Vocabulary: Have, go, come.

    Reading: what a DNA polymerase can do

    Speaking: what are your plans?

    Listening: Evolution of using DNA testing to solve crimes

    - Write a short report describing how a specific enzyme (e.g. DNA polymerase) is used in forensic analysis.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.

    Neurochimie et Comportement

    Anatomie et physiologie humaines (02)

    Criminalité Environnementale

    Chimie Analytique 2

    Atelier Biologie Forensique (01)

    Atelier de Biochimie Forensique

    UE découverte

    Fondements Criminologiques pour les Sciences Forensiques

    Botanique forensique

    UE transversale

    English for biologists - Elementary

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Semestre 29 matières
  1. Neurochimie et Comportement
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 70h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S2
    Neurochimie et Comportement

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en biologie cellulaire, biochimie et neurophysiologie sont recommandées pour suivre ce module.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module vise à fournir une compréhension approfondie des fondements chimiques des fonctions cérébrales et de leur influence sur le comportement humain. Il permet d’étudier les neurotransmetteurs, neuromodulateurs et hormones impliquées dans la régulation des émotions, de la prise de décision et des interactions sociales. Par ailleurs, il analyse les liens entre les altérations chimiques du cerveau et les comportements criminels ou pathologiques, afin d’appliquer ces connaissances de manière concrète dans le cadre des expertises en biologie criminalistique.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Introduction à la chimie cérébrale

    Composition chimique du cerveau.

    Concepts fondamentaux de la biochimie neuronale.

    Synapse chimique vs synapse électrique.

    Chapitre 2 : Structure et fonction des neurotransmetteurs

    Classification des neurotransmetteurs.

    Synthèse, stockage et libération.

    Mécanismes de recapture et dégradation.

    Chapitre 3 : Neurotransmetteurs excitateurs et inhibiteurs

    Glutamate et GABA : rôle dans l’équilibre excitation/inhibition.

    Impact sur le comportement et la cognition.

    Chapitre 4 : Système dopaminergique et comportements

    Rôle de la dopamine dans la motivation, la récompense et l’addiction.

    Dopamine et comportements impulsifs/agressifs.

    Chapitre 5 : Système sérotoninergique et régulation émotionnelle

    Fonction de la sérotonine dans l’humeur et l’anxiété.

    Implications dans les troubles du comportement.

    Chapitre 6 : Noradrénaline et réponse au stress

    Mécanismes neurochimiques du stress.

    Effets sur la prise de décision et l’agressivité.

    Chapitre 7 : Neurohormones et modulation sociale

    Ocytocine, vasopressine et comportements sociaux.

    Neurochimie de l’empathie et de la confiance.

    Chapitre 8 : Interaction neuroendocrinienne dans la chimie cérébrale

    Influence des hormones stéroïdes (testostérone, œstrogènes) sur la neurotransmission.

    Impact sur les comportements sexuels et agressifs.

    Chapitre 9 : Altérations neurochimiques associées aux comportements criminels

    Déséquilibres neurochimiques et propension à la violence.

    Études de biomarqueurs neurochimiques en criminalistique.

    Chapitre 10 : Effets des substances psychoactives sur la chimie cérébrale

    Drogues, médicaments et perturbations neurochimiques.

    Influence sur la commission d’actes criminels.

    Chapitre 11 : Bases toxicologiques en neurochimie criminalistique

    Analyse des substances neuroactives dans les expertises médico-légales.

    Techniques de détection et interprétation des résultats.

    Chapitre 12 : Perspectives et limites de la neurochimie en biologie criminalistique

    Applications actuelles et futures.

    Questions éthiques et scientifiques.

    Intégration multidisciplinaire dans l’expertise criminelle.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  2. Anatomie et physiologie humaine (02)
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S2
    Anatomie et physiologie humaine (02)

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Validation du module Anatomie et Physiologie Humaines 1. Notions élémentaires en biologie moléculaire appliquée.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Le module a pour objectif d’approfondir la connaissance des systèmes complexes du corps humain, tels que les systèmes cardiovasculaire, respiratoire, endocrinien, immunitaire et génital. Il met l’accent sur la compréhension des mécanismes physiologiques intégrés et des interactions entre ces systèmes, tout en développant des compétences pratiques pour mieux analyser les fonctions corporelles.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Système nerveux périphérique et autonome

    Nerfs crâniens et rachidiens : structure et fonctions

    Réflexes et arcs réflexes

    Système nerveux autonome : sympathique et parasympathique

    Chapitre 2 : Système endocrinien

    Glandes endocrines principales et leurs hormones

    Mécanismes d’action hormonale

    Régulation hormonale et rétrocontrôle

    Chapitre 3 : Système cardiovasculaire

    Anatomie du cœur : cavités, valves, circulation sanguine

    Cycle cardiaque et électrophysiologie

    Vaisseaux sanguins : artères, veines, capillaires

    Pression artérielle et régulation

    Chapitre 4 : Système lymphatique et immunitaire

    Anatomie des vaisseaux lymphatiques et ganglions

    Fonctions du système lymphatique

    Principes de l’immunité innée et adaptative

    Chapitre 5 : Système respiratoire

    Anatomie des voies respiratoires supérieures et inférieures

    Mécanique de la respiration

    Échanges gazeux au niveau des alvéoles pulmonaires

    Chapitre 6 : Système digestif approfondi

    Anatomie détaillée des organes digestifs

    Processus de digestion, absorption et motilité

    Chapitre 7 : Système urinaire approfondi

    Anatomie des reins, uretères, vessie, urètre

    Fonction rénale : filtration, réabsorption, sécrétion

    Régulation hydrique et électrolytique

    Chapitre 8 : Système reproducteur

    Anatomie des appareils reproducteurs masculin et féminin

    Fonctionnement physiologique et cycles

    Chapitre 9 : Métabolisme et régulation de la température corporelle

    Concepts de métabolisme de base

    Thermorégulation et mécanismes associés

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  3. Criminalité Environnementale
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: 01h30Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S2
    Criminalité Environnementale

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Connaissances en biologie, en écologie, en chimie et en criminalistique.

    Objectifs

    Objectif de l’enseignement

    Le module a pour objectif d'offrir aux étudiants une compréhension approfondie des principes de la criminalistique appliqués aux enjeux environnementaux, en développant des compétences pratiques d’échantillonnage et d’analyse des preuves.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Définitions et portée

    Concept et champ de la criminalité environnementale.

    Typologie : pollution, déforestation, trafic d’espèces, pêche illégale.

    Chapitre 2 – Impacts écologiques globaux

    Effets sur la biodiversité et services écosystémiques.

    Menaces : changements climatiques, désertification, acidification des océans.

    Chapitre 3 – Pollution et dégradation des milieux

    Pollution de l’air, de l’eau et des sols : sources, métaux lourds, perturbateurs endocriniens.

    Altération des habitats : effondrement des récifs, déforestation tropicale.

    Chapitre 4 – Trafic d’espèces et exploitation illégale

    Braconnage et trafic : espèces menacées, plantes médicinales.

    Pêche INN et déversements marins : hydrocarbures, plastiques.

    Chapitre 5 – Outils de surveillance écologique

    Bio-indicateurs : macroinvertébrés, diatomées.

    eDNA : principes, applications à la traçabilité des infractions.

    Technologies : drones, capteurs, imagerie satellite.

    Chapitre 6 – Impacts de l’environnement sur la criminalité

    Influence sur le comportement : pollution, stress urbain, pollution sonore, climat.

    Études de cas : violences post-catastrophe, migrations climatiques.

    Chapitre 7 – Cadre juridique international et national

    Conventions clés : CITES, accords de Paris, Protocoles de Kyoto.

    Législation algérienne : responsabilités, sanctions, rôle des ONG.

    Chapitre 8 – Taphonomie forensique environnementale

    Facteurs abiotiques : température, humidité, pH du sol.

    Biote : insectes, microbes, algues affectant la décomposition et l’intégrité de l’ADN.

    Protocoles de prélèvement : adaptation en milieu naturel (zones humides, désert).

    Chapitre 9 – Criminalité microbiologique et bioterrorisme

    Détection d’agents pathogènes : PCR, MALDI-TOF.

    Microbiome pour PMI : uses et limites.

    Chapitre 10 – Toxicologie forensique environnementale

    Dépistage de polluants : GC-MS, LC-MS/MS.

    Écotoxicologie : effets sur la chaîne alimentaire.

    Chapitre 11 – Prévention et gestion durable

    Politiques publiques : aires protégées, zones de non-traitement.

    Biotechnologies : phytoremédiation, bactéries dépolluantes.

    Chapitre 12 – Conflits environnementaux et sécurité alimentaire

    Surexploitation : crise halieutique, ressources forestières.

    Migrations et sécurité : pressions démographiques, accès à l’eau.

    Chapitre 13 – Synthèse et perspectives

    Revue transversale des infractions et des méthodes forensiques.

    Innovations : IA pour détection de déversements, blockchain pour traçabilité.

    Évaluation

    d) Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    e) Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  4. Chimie Analytique2
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S2
    Chimie Analytique2

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Notions fondamentales de Chimie générale, Mathématiques appliquées à la chimie, Techniques de laboratoire chimique, Statistiques appliquées, Informatique appliquée à la chimie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L’enseignement vise à introduire les principes fondamentaux et les techniques essentielles pour l'analyse qualitative et quantitative des substances chimiques, en mettant l'accent sur l'acquisition de compétences pratiques dans l'utilisation d'instruments analytiques et l'interprétation critique des résultats.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction à la Chimie Analytique

    Définition et objectifs de la chimie analytique

    Présentation des principes fondamentaux de la discipline

    Importance de la chimie analytique dans divers domaines tels que l'industrie, la santé et l'environnement

    Historique de la chimie analytique

    Évolution des techniques et des méthodes analytiques au fil du temps

    Contributions de différents scientifiques à l'avancement de la discipline

    Chapitre 2 – Méthodes de Prélèvement et de Préparation des Échantillons

    Principes de prélèvement des échantillons

    Techniques d'échantillonnage pour différents types de matrices (liquides, solides, gaz)

    Facteurs à considérer lors du prélèvement pour assurer la représentativité de l'échantillon

    Préparation des échantillons

    Techniques de préparation pour l'analyse qualitative et quantitative

    Extraction, purification et concentration des analytes

    Chapitre 3 – Techniques d'Analyse Qualitative

    Analyse chimique qualitative

    Principes des différentes méthodes d'analyse qualitative (gravimétrique, volumétrique, spectroscopique)

    Identification des ions et des composés inorganiques

    Spectroscopie

    Spectroscopie d'absorption atomique (SAA)

    Spectroscopie d'émission atomique (SEA)

    Spectroscopie d'absorption moléculaire (UV-Vis, IR)

    Chapitre 4 – Techniques d'Analyse Quantitative

    Analyse chimique quantitative

    Principes des méthodes quantitatives (titrage, gravimétrie, spectroscopie)

    Détermination des concentrations et des quantités d'analytes

    Chromatographie

    Chromatographie en phase liquide (HPLC)

    Chromatographie en phase gazeuse (GC)

    Chromatographie en phase supercritique (SFC)

    Chapitre 5 – Méthodes Instrumentales Avancées

    Spectrométrie de Masse

    Principes de fonctionnement de la spectrométrie de masse

    Applications en chimie analytique pour l'identification et la quantification des composés

    Spectrométrie d'Absorption Atomique (SAA)

    Techniques d'analyse des métaux et des éléments traces

    Applications en environnement, alimentation et santé

    Chapitre 6 – Validation des Méthodes Analytiques

    Validation des méthodes analytiques

    Critères de validation (sensibilité, spécificité, linéarité, précision, exactitude)

    Étapes de validation des méthodes

    Contrôle de Qualité

    Utilisation de standards et de matériaux de référence

    Assurance qualité et contrôle interne des résultats analytiques

    Chapitre 7 – Applications en Industries et en Recherche

    Applications industrielles

    Utilisation de la chimie analytique dans l'industrie pharmaceutique, agroalimentaire, cosmétique, pétrochimique, etc.

    Contrôle qualité et réglementations

    Applications en recherche

    Contributions de la chimie analytique à la recherche scientifique

    Développement de nouvelles méthodes et techniques analytiques

    Chapitre 8 – Travaux Pratiques et Études de Cas

    Travaux pratiques en laboratoire

    Manipulations expérimentales pour mettre en œuvre les techniques analytiques

    Interprétation des résultats et rédaction de rapports

    Études de cas et résolution de problèmes

    Analyse de situations réelles rencontrées en chimie analytique

    Développement de compétences en résolution de problèmes analytiques

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  5. Atelier Biologie Forensique 1
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 60h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 04h00Autres heures: 60h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

    Explorer la matière
    S2
    Atelier Biologie Forensique 1

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Connaissances générales en biologie cellulaire et microbiologie. Notions de base sur les scènes de crime (cours théorique préalable recommandé).

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Comprendre les principes fondamentaux de la biologie forensique. Apprendre à sécuriser une scène de crime et à respecter la chaîne de custodie.

    Programme

    Contenu de la matière

    TP1 : Introduction à la biologie forensique et gestion de scène de crime biologique

    Notions de biosécurité, prélèvements, chaîne de custodie

    Équipements et protocole de terrain

    TP2 : Prélèvements et conditionnement d’échantillons biologiques

    Sang, salive, cheveux, sécrétions

    Supports de prélèvements et conservation

    TP3 : Techniques de détection du sang latent

    Luminol, Bluestar, Kastle-Meyer

    Précautions et limites d’interprétation

    TP4 : Typage sanguin ABO et tests préliminaires

    Réactions antigène/anticorps

    Applications forensiques

    TP5 : Extraction d’ADN à partir d’échantillons biologiques

    Méthodes manuelles et semi-automatisées

    Évaluation

    Évaluation de la qualité et quantité de l’ADN
    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  6. Atelier de Biochimie Forensique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

    Explorer la matière
    S2
    Atelier de Biochimie Forensique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Notions de base de chimie et de biochimie structurale.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cette matière vise à initier les étudiants aux techniques expérimentales de base en biochimie, en développant leur capacité à concevoir, réaliser et analyser des protocoles, tout en renforçant la rigueur scientifique et les bonnes pratiques de laboratoire.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 : Préparation des solutions

    Rappel sur l’expression des concentrations (notions de molarité, molalité, normalité, dilution…)

    Les tampons (préparation, pKa, choix du tampon …ect)

    Manipulations de base : verrerie, volumes et pipetage

    Atelier 2 : Méthodes de précipitation des protéines

    Effet du pH (pI)

    Précipitation par sels (salting-out)

    Précipitation par solvants (éthanol)

    Atelier 3 : Dosage des protéines par méthodes spectrophotométriques

    Méthode de Lowry

    Méthode de Bradford

    Atelier 4 : Chromatographie d’exclusion de taille

    Démonstration par séparation de molécules colorées (Bleu de dextran / Fluorescéine)

    Application à la purification de protéines

    Analyse des fractions collectées par spectrophotométrie

    Atelier 5 : Chromatographie échangeuse d’ions

    Application à la purification de protéines du lactosérum

    Analyse des fractions collectées par spectrophotométrie

    Chromatographie d’affinité (IMAC : Enseignement théorique)

    Atelier 6 : Electrophorèses des protéines en condition dénaturante : SDS-PAGE

    Tricine-SDS-PAGE (Electrophorèses des peptides : Enseignement théorique)

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  7. Fondements Criminologiques pour les Sciences Forensiques
    2 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: 01h30Autres heures: 25h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S2
    Fondements Criminologiques pour les Sciences Forensiques

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Bases en sociologie, droit pénal et en psychologie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Pour appréhender le phénomène criminel dans son ensemble et dans ses spécificités, l’étude des grandes théories criminologiques est une étape indispensable dans la formation du futur criminologiste.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : L'école classique (XVIIIᵉ - début XIXᵉ siècle)

    Contexte historique : Lumières et révolution des idées.

    Cesare Beccaria et la notion de responsabilité individuelle.

    Jeremy Bentham et le principe d'utilitarisme.

    Les concepts de peine proportionnelle, libre arbitre et choix rationnel.

    Chapitre 2 : L'école positiviste (XIXᵉ siècle)

    Rupture avec l'école classique : déterminisme biologique et social.

    Cesare Lombroso et l'atavisme criminel.

    Enrico Ferri et l’environnement social.

    Rafael Garofalo et la notion de dangerosité.

    Evaluation.

    Chapitre 3 : Les théories psychologiques du crime

    Approches psychanalytiques (Freud, concepts du Ça, Moi, Surmoi).

    Approches comportementalistes et cognitives.

    Troubles de la personnalité (sociopathie, psychopathie).

    Chapitre 4 : La théorie de l'anomie

    Emile Durkheim : l'anomie sociale et le suicide.

    Robert K. Merton : Strain Theory et adaptations déviantes.

    Application aux sociétés modernes.

    Chapitre 5 : Les théories de la désorganisation sociale

    L'école de Chicago : contexte urbain et criminalité.

    Shaw et McKay : les zones urbaines de criminalité.

    Impact de la mobilité sociale et du tissu communautaire.

    Chapitre 6 : La théorie de l’apprentissage différentiel

    Edwin Sutherland : la criminalité comme comportement appris.

    Principes du contact différentiel.

    Héritages et critiques.

    Chapitre 7 : Les théories du contrôle social

    Travis Hirschi : Social Bond Theory.

    Michael Gottfredson et Travis Hirschi : Self-Control Theory.

    Crime et faiblesse des liens sociaux.

    Chapitre 8 : Les théories critiques de la criminologie

    Criminologie marxiste : inégalités économiques et criminalité.

    Théories féministes : genre et justice pénale.

    Criminologie verte : écocriminalité.

    Chapitre 9 : Criminologie et justice forensique

    Application des théories à l'investigation criminelle.

    Profilage criminel et construction de typologies.

    Limites et utilités dans les enquêtes forensiques.

    Chapitre 10 : Réflexions contemporaines

    Nouveaux champs d'investigation : cybercriminalité, criminalité environnementale, terrorisme.

    Besoins de théories adaptées aux réalités du XXIᵉ siècle.

    Synthèse.

    Évaluation

    Mode d’évaluation

    Contrôle continu : 40% (exposés, analyses de cas criminels, quizz)

    Examen final : 60% (questions de réflexion et études de cas)

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  8. Botanique forensique
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S2
    Botanique forensique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Biologie végétale, Botanique, Ecologie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Enseigner aux étudiants comment utiliser les connaissances botaniques dans le cadre des enquêtes criminelles.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction à la botanique forensique :

    Définition de la botanique forensique et son importance dans les enquêtes criminelles

    Historique et développement de la discipline

    Méthodes d'analyse en botanique forensique :

    Collecte et préservation des échantillons botaniques sur les scènes de crime

    Techniques d'identification des plantes, y compris l'utilisation de clés de détermination, de microscopie et de biologie moléculaire

    Utilisation des plantes dans les enquêtes criminelles :

    Décomposition des végétaux comme indicateur de la chronologie des événements

    Analyse de la végétation pour déterminer le lieu de décès ou de dépôt de preuves

    Palynologie forensique :

    Analyse des pollens et des spores pour retracer les déplacements des suspects ou des victimes

    Utilisation de la palynologie pour dater des échantillons et reconstituer les scènes de crime

    Entomologie forensique végétale :

    Étude des insectes associés aux plantes en décomposition

    Utilisation des insectes pour estimer le temps depuis le décès ou la déposition des cadavres

    Cas pratiques et études de cas :

    Analyse de cas réels où la botanique forensique a joué un rôle crucial dans la résolution d'enquêtes criminelles

    Études de scénarios fictifs pour illustrer les applications potentielles de la botanique forensique

    Développements récents et tendances futures :

    Nouvelles technologies et avancées en botanique forensique

    Défis et opportunités pour l'application de la botanique forensique dans le domaine de la justice criminelle

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  9. English for biologists - Elementary
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 05h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S2
    English for biologists - Elementary

    Repères

    Connaissances préalables recommandées
    Prior knowledge of basic English.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    This course aims to help students build strong skills in speaking and writing in English.

    Programme

    Contenu de la matière

    Unit 1: Tell me what’s it like

    Grammar: What it's like to? Comparative and superlative adjectives in biology.

    Vocabulary: Talking about modern life and crimes!.

    Reading: A story of two plants or insects in forensic investigations" - Forensic use of plants / insects in criminal cases.

    Speaking: Comparing different forensic applications of plants / insects

    Listening: How insects and plants are used in forensic investigations.

    Writing: Describing a crime scene where plant or insect evidence plays a key role.

    Unit 2: Asking scientific questions

    Grammar: Present perfect and past simple in scientific writing.

    Vocabulary: Adverbs in experimental protocols (slowly, carefully…).

    Reading: scientist interview

    Speaking: questionnaire for research.

    Listening: Interview with a forensic biologist

    Writing: writing a research protocol.

    Unit 3: Do and don’t in the science Lab

    Grammar: Have to, got to, should, must.

    Vocabulary: Science laboratory safety symbols and hazard signs.

    Reading: How biologists ensure safety in criminal investigations through lab protocols

    Speaking: Do I need to be good at math to excel in biology? One question, many answers.

    Listening: Fire safety in the Lab.

    Writing: Should I have good mathematical and statistical skills? (Argument essay).

    Unit 4: Inventions that changed the world

    Grammar: Passive voice.

    Vocabulary: past participle verbs used in scientific writing

    Reading: The Role of DNA Analysis in Forensic Science

    Speaking: Passive voice battleship.

    Listening: How molecular biology revolutionized criminal investigations

    Writing: Write a review of a documentary about how scientific police solve crimes

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)

    Psychopathologie et Criminalité

    Entomologie forensique

    Biologie moléculaire 2

    Toxicologie Forensique

    Atelier Biologie Forensique (02)

    Atelier d’entomologie Forensique

    UE découverte

    Anthropologie et victimologie criminelles

    Droits de Propriété Intellectuelle

    UE transversale

    Bio-programmation 1

    English for biologists – Intermediate

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Semestre 310 matières
  1. Psychopathologie et criminalité
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S3
    Psychopathologie et criminalité

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    La psychologie générale, la génétique humaine et la criminologie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Comprendre les principaux troubles mentaux associés à la criminalité et identifier les facteurs de risque et les moyens de protection.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction à la psychopathologie forensique

    Définitions et périmètre : psychopathologie, criminalité, lien entre troubles mentaux et actes criminels

    Histoire et évolution du champ : des premiers traités médico-légaux à l’émergence de la psychiatrie forensique

    Rôle de l’expert : place du psychologue/psychiatre en justice, limites éthiques et déontologiques

    Chapitre 2 – Modèles explicatifs de la délinquance

    Modèle bio-psycho-social : interactions gènes, neurobiologie et environnement

    Neurobiologie de l’agressivité : circuits limbique et préfrontal, rôle de la dopamine et de la sérotonine

    Facteurs psychosociaux : attachement, traumatisme précoce, influence familiale et pairale

    Chapitre 3 – Troubles de la personnalité et criminalité

    Personnalité antisociale (ASPD) : critères DSM-5, comportements violant les droits d’autrui

    Psychopathie : construct Cleckley / Hare et évaluation PCL-R

    Profil épidémiologique : prévalence ASPD vs psychopathie en population générale et carcérale

    Chapitre 4 – Autres troubles de la personnalité (Cluster B)

    Narcissique : grandiosité, besoin d’admiration, manque d’empathie

    Borderline : instabilité émotionnelle, impulsivité, risque suicidaire

    Histrionique : recherche d’attention, théâtralité, séduction comme stratégie de manipulation

    Chapitre 5 – Troubles liés à l’usage de substances

    Addictions en contexte criminel : rôle des stimulants, dépresseurs et hallucinogènes dans la désinhibition

    Comorbidités psychiatriques : ASPD et toxicomanie, impact sur la récidive

    Chapitre 6 – Traumatisme, stress post-traumatique et agression

    PTSD : symptômes d’intrusion, évitement, hyperactivation

    Trauma complexe : maltraitance infantile, violence conjugale et lien avec la délinquance

    Approches thérapeutiques : EMDR, TCC focale sur le trauma

    Chapitre 7 – Psychoses et actes criminels

    Schizophrénie et troubles délirants : délire de persécution, hallucinations commandantes

    Criminalité associée : études statistiques, rôle des comorbidités (substances, évictions sociales)

    Insanité et responsabilité pénale : critères légaux (article 122-1 CP), expertise psychiatrique

    Chapitre 8 – Délinquance sexuelle et psychopathologie

    Typologies d’auteurs : pédophilie, exhibitionnisme, fétichisme

    Outils d’évaluation : STATIC-99, RSVP, mesures dynamiques du risque

    Traitements et prévention : thérapies cognitivo-comportementales et pharmacologiques

    Chapitre 9 – Évaluation clinique forensique

    Entretien semi-structuré (SCID-5-CV) : diagnostic différentiel, construction du cas clinique

    Échelles et tests projetifs : MMPI-2, Rorschach, implications légales

    Usages et limites : fiabilité inter-juges, biais culturels

    Chapitre 10 – Profilage criminel et neurosciences

    Bases du profiling : méthodes inductives vs déductives (FBI, IP)

    Apports de l’imagerie cérébrale : IRMf, TEP pour comprendre tendances violentes

    Éthique et validité : controverses autour du déterminisme biologique

    Chapitre 11 – Gestion du risque et mesures de sécurité

    Concepts de récidive et d’imprévisibilité : Taux de faux positifs, score de violence future

    Programmes de prise en charge : suivi GPS, centres de jour et hospitalisations sous contrainte

    Normes et recommandations : Hagellande, NICE (UK), Haute Autorité de Santé (France)

    Chapitre 12 – Victimologie et impact post-infraction

    Réactions des victimes : stress post-traumatique, syndrome de Stockholm

    Chapitre 13 – Interventions thérapeutiques et réhabilitation

    Approches multimodales : TCC, thérapies de groupe, interventions familiales

    Programmes spécifiques : résolution de conflit, gestion des impulsions

    Chapitre 14 – Études de cas et simulation d’expertise

    Analyses de dossiers célèbres : Manson, Dahmer, Anders Breivik

    Rédaction de rapports d’expertise : structure, clarté, argumentation scientifique

    Simulations de témoignage oral : atelier de dépôt devant « jury », gestion du contre-interrogatoire

    Évaluation

    Évaluations spécifiques : tests biologiques, entretiens motivationnels
    Évaluation médico-légale : croisement témoignage/preuves, fiabilité des souvenirs

    Protection et suivi : prise en charge psychologique, dispositifs juridiques (VOA, indemnisation)

    Évaluation de l’efficacité : indicateurs de récidive, qualité de vie post-libération
    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc
  2. Entomologie forensique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Entomologie forensique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en biologie générale, en entomologie fondamentale, des notions de criminalistique ainsi que des compétences de laboratoire.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Au terme du cours d'Entomologie Forensique, les étudiants seront capables de comprendre et d'appliquer les principes fondamentaux de cette discipline. Ils sauront collecter, analyser et interpréter les données entomologiques sur les scènes de crime pour estimer avec précision le post-mortem interval. De plus, ils seront en mesure d'évaluer les facteurs environnementaux et saisonniers influençant la colonisation des cadavres par les insectes, ainsi que de reconnaître le rôle crucial de l'entomologie forensique dans le processus judiciaire. Précision : l’estimation doit expliciter ses incertitudes ; l’âge des insectes étaye souvent un intervalle minimal, sans garantir une heure exacte du décès.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction et historique

    Définition et portée de l’entomologie forensique.

    Repères historiques : des premières observations médiévales aux protocoles modernes.

    Domaines d’application : PMI, localisation, entomotoxicologie, sécurité alimentaire.

    Acteurs institutionnels : AFQSE, AAFS, normes internationales

    Chapitre 2 – Anatomie et morphologie externes

    Tête : antennes, pièces buccales – distinctions Calliphoridae/Sarcophagidae

    Thorax : segmentation, types d’ailes, pattes – adaptations nécrophages

    Abdomen : spiracles, stigmates respiratoires pour stade larvaire

    Morphologie larvaire : spicules, soies, critères d’identification

    Chapitre 3 – Cycle de vie et développement

    Stades ontogénétiques : œuf, L1–L3, pupe, adulte – durées indicatives

    Effets abiotiques : température (loi de Van ’t Hoff), humidité, substrat

    Accumulated Degree-Hours (ADH) et Days (ADD) : calculs et utilisation pour PMI

    Variabilité interspécifique : Chrysomya vs Lucilia spp.

    Chapitre 4 – Biologie reproductive et communication

    Comportement d’accouplement : repérage du site de ponte

    Phéromones : composition chimique, diffusion et rôle attractif

    Sélection des sites de ponte : préférence pour tissus nécrosés, facteurs olfactifs

    Signaux multimodaux : vibrations, température

    Chapitre 5 – Alimentation, nutrition et succession entomologique

    Stratégies trophiques : nécrophage primaire vs secondaire

    Phases de décomposition : fraîche, putréfaction, fermentation – communautés successives

    Interactions interspécifiques : compétition larvaire, prédation par Dermestidae

    Modèles prédictifs : succession standardisée vs environnement urbain

    Chapitre 6 – Systématique et taxonomie

    Clés morphologiques : utilisation de Byrd & Castner (2001)

    Caractères diagnostiques : genitalia, microstructures cuticulaires

    Approches moléculaires : séquençage COI, barcode BOLD

    Intégration morpho–génomique : phylogénie rapide

    Chapitre 7 – Techniques de collecte sur scène

    Matériel : pinces, aspirateurs entomologiques et pièges.

    Protocole : points d’échantillonnage fixes et temporels

    Conservation : éthanol 70 %, stockage à 4 °C, étiquetage, CoC

    Sécurité et contamination : protection, stérilité

    Chapitre 8 – Élevage et expérimentation

    Laboratoire d’élevage : substrats, boîtes, conditions contrôlées

    Collecte de données : relevés horaires, courbes de croissance

    Techniques d’ablation : prélèvements larvaires pour analyses

    Variations simulées : fluctuations de température

    Chapitre 9 – Estimation du PMI

    Méthodes statiques : âge de la larve la plus vieille

    Méthodes dynamiques : modélisation bayésienne avec R.

    Uncertainties & validation : bootstrap, intervalles crédibles

    Études de cas : scénarios simulés vs données réelles

    Chapitre 10 – Entomotoxicologie

    Principe : insectes comme matrice pour détecter drogues/poisons

    Extraction : méthodes de lyse, purification

    Analyse : GC-MS, immuno-essais, LC-MS

    Interprétation : relation dose-effet, impact sur développement

    Chapitre 11 – Effets du climat et données spatiales

    Changements climatiques : impact sur développement et PMI

    Modélisation SIG : distribution d’espèces nécrophages

    Scénarios extrêmes : sécheresse, inondation

    Adaptations évolutives : espèces invasives

    Chapitre 12 – Admissibilité et rapport d’expert

    Normes Daubert & Frye : critères d’admission des preuves entomologiques Ces critères relèvent des contextes judiciaires qui les appliquent ; ils ne sont pas présentés comme une règle universelle.

    Rédaction : structure IMRaD, annexes, rigueur scientifique

    Témoignage : préparation, cross-examination

    Gestion des preuves : chaîne de possession intégrale

    Chapitre 13 – Éthique et déontologie

    Prélèvements humains : consentement, règlementations légales

    Impartialité : conflits d’intérêt, financement

    Biodiversité et conservation : impact des prélèvements

    Confidentialité : données sensibles des enquêtes

    Chapitre 14 – Innovations et perspectives

    Imagerie 3D & drones : collecte automatisée de terrains

    Omics & métagénomique : détection simultanée de communautés

    Intelligence artificielle : reconnaissance d’espèces, prédiction PMI

    Défis futurs : législation internationale, bioéthique, collaboration globale

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  3. Biologie moléculaire 2
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Biologie moléculaire 2

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Génétique, Expression des gènes, signalisation et communication cellulaire, biodiversité.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cette unité d’enseignement porte trois parties. L’objectif de la première partie est d’expliquer les mécanismes de synthèse et de l’action des ARN interférents et mettre le point sur leurs intérêts et applications. Le but de la deuxième partie est d’expliquer les différents mécanismes de régulation de l’expression des gènes. La troisième partie vise à décrire les différents outils de la biologie moléculaire utilisés pour étudier la diversité génétique des espèces.

    Programme

    Contenu de la matière

    Partie 1/ Interférence ARN

    1/ Historique et mécanismes fondamentaux de l’interférence ARN

    1. Historique de l’interférence ARN

    2. Mécanismes fondamentaux de l’interférence ARN

    2.1. siARN

    2.1.1. Biosynthèse

    2.1.2. Mécanisme d’action

    2.2. miARN

    2.2.1. Biosynthèse

    2.2.2. Mécanisme d’action

    2.3. piARN

    2.3.1. Biosynthèse

    2.3.2. Mécanisme d’action

    II/ Conséquences pratiques pour la conception d’un siARN

    1. Influence des propriétés intrinsèques du siARN

    2. Limites imposées par le transcrit cible

    III / intérêts de l’interférence ARN

    1. Un outil pour la compréhension de la fonction des gènes

    2. Un outil pour de nombreuses applications en thérapeutique

    IV/ Contraintes associées à la transfection de courtes séquences d’acidesnucléiques

    1. La stabilité des ARN interférents

    2. La biodistribution

    Partie 2/ Régulation de l’expression des gènes

    Régulation de la transcription

    Régulation de la transcription chez les procaryotes

    Qu’est-ce qu’un opéron ?

    Opéron catabolique inductible négativement et positivement régulé (exemple : l’opéron lactose chez E. coli)

    Opéron anabolique répressible (exemple : l’opéron Tryptophane chez E. coli)

    Régulation par transformation d’un répresseur en activateur (exemple : l’opéron Arabinose (araBAD) chez E. coli)

    Autres exemples d’opéron

    Régulation de la formation du complexe ouvert

    Régulation du passage à la phase d’élongation

    Régulation de la transcription chez les eucaryotes

    Régulation au niveau chromatinien

    Acétylation, méthylation des histones

    Méthylation de l’ADN

    Eléments de régulation transcriptionnelle

    Les classes de régulateurs transcriptionnels

    Fonctionnement des protéines activatrices de transcription

    Répresseurs transcriptionnels

    Séquences régulatrices enhancers et les silencers

    Extinction de gènes et régulation épigénétique

    Régulation post-transcriptionnelle chez les eucaryotes

    L’épissage alternatif

    Régulation par des petits ARN

    Régulation de la stabilité des ARNm chez les eubactéries

    Les acteurs de la dégradation

    Les exoribonucléases

    Les endoribonucléases

    L’ARN pyrophosphohydrolase (RppH)

    Les mécanismes de dégradation des ARNm

    La voie directe d’accès

    La voie dépendante de l’extrémité5’

    La voie exoribonucléolytique en 3’

    Les mécanismes régulant la stabilité des ARNm

    Régulation de l’activité et de la concentration des RNases

    Les effets de la traduction

    L’interférence par les ARNs

    L’influence de la séquence des ARNm

    Régulation de la stabilité des ARNm chez les eucaryotes

    Les acteurs de la dégradation

    Les exoribonucléases agissant en 3’ de l’ARNm

    Les exoribonucléases agissant en 5’ de l’ARNm

    Les endoribonucléases

    Les mécanismes de la dégradation

    Voie majoritaire

    Voies alternatives

    Les mécanismes régulant la stabilité des ARNm

    Le complexe Lsm1-7

    La régulation de la déadénylation

    La régulation du complexe d’élimination de la coiffe

    Les ARN interférents :miARN, siARN et piARN

    Régulation de la traduction

    Introduction

    Régulation de l’initiation de la traduction chez les eubactéries

    Régulation de l’accès au RBS

    Régulation via les structures secondaires de l’ARNm

    Régulation de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes

    Régulation via les facteurs d’initiation de la traduction

    Hosphorylation du facteur d’initiation eIF2

    Phosphorylation des protéines 4E-BP et disponibilité du facteur d’initiatione IF4E

    Inhibition de l’initiation par les miARN

    Régulation via les régions 5’-et 3’-UTR chez les eucaryotes

    Régulation via les régions 5’-UTR

    Interaction régions 3’- et 5’-UTR

    Régulation via 3’-UTR

    Les voies alternatives d’initiation

    uORF

    Initiation par une séquence IRES

    Régulation au cours de l’élongation ou de la terminaison chez les eubactéries

    Régulation au cours de l’élongation ou de la terminaison chez les eucaryotes

    Régulation post-traductionnelle : la dégradation des protéines intracellulaires

    Introduction

    Les protéines chaperonnes (chaperonines)

    Les enzymes protéolytiques

    Ubiquitination des protéines

    Protéasome

    Dégradation lysosomale

    Autophagie

    Partie 3/ Apport de la biologie moléculaire à l’étude de la diversité génétique

    Quelques notions

    Biodiversité

    Diversité génétique

    Mesure de la diversité génétique

    Marqueurs morphologiques

    Marqueurs protéiques (biochimiques)

    Marqueurs ADN (moléculaires)

    RFLP

    AFLP

    Minisatellites

    Microsatellites

    SNP

    Marqueurs d’ADNmt

    Exemples d’applications

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  4. Toxicologie forensique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Toxicologie forensique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Chimie générale et organique ; Principes de base en analyse chimique , biologie cellulaire, physiologie et des notions élémentaires en statistiques.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    À l’issue de ce module, les étudiants seront capables de :

    Comprendre les fondements et le rôle de la toxicologie forensique dans les enquêtes judiciaires.

    Maîtriser les principes pharmacocinétiques (absorption, distribution, métabolisme, excrétion) appliqués aux substances toxiques.

    Appliquer rigoureusement les méthodes analytiques (immuno-essais, GC-MS, LC-MS, AAS) pour détecter et quantifier drogues et poisons.

    Réaliser des analyses post-mortem et de performance humaine (toxicité aiguë, éthylotest).

    Interpréter les profils toxicologiques, évaluer la fiabilité des résultats et rédiger des rapports d’expert admissibles en justice.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction à la toxicologie forensique

    Ce premier chapitre définit la discipline, retrace son histoire (Orfila, Marsh, Stas-Otto) et précise les objectifs du toxicologue en contexte judiciaire :

    Définitions et périmètre : toxicologie médicolégale, toxicologie de la performance, dépistage en milieux professionnels.

    Rôle et organisation : place du toxicologue dans l’enquête, structure d’un laboratoire forensique.

    Chaîne de possession : traçabilité et intégrité des preuves (CoC).

    Accréditation et qualité : normes ISO 17025, bonnes pratiques de laboratoire.

    Chapitre 2 – Principes de base et relation dose-réponse

    On y aborde les concepts essentiels de la toxicité :

    Toxicité aiguë vs chronique : différences et exemples cliniques.

    Courbe dose-réponse : notion de DL₅₀, ED₅₀, indice thérapeutique.

    Marge de sécurité et seuils légaux (alcoolémie, THC, opiacés) : distinguer les limites légales des seuils de sécurité biologique.

    Équivalence pharmacologique : comparaison de molécules selon leur puissance.

    Chapitre 3 – Pharmacocinétique (ADME)

    Mécanismes d’entrée, de devenir et d’élimination des substances :

    Absorption : voies orale et inhalée ; la voie intraveineuse court-circuite l’absorption.

    Distribution : volume de distribution, fixation aux protéines plasmatiques.

    Métabolisme : phase I (oxydations / cytochrome P450) et phase II (conjugaisons).

    Excrétion : rénale, biliaire, pulmonaire (kₑ, t₁/₂).

    Chapitre 4 – Échantillonnage et conservation

    Ce chapitre traite de la collecte et du traitement des matrices biologiques :

    Matrices classiques : sang (central vs périphérique), urine, salive, cheveux.

    Matrices post-mortem : liquide céphalorachidien, tissus (foie, rein).

    Conditions de prélèvement : choix des volumes, anticoagulants, température.

    Conservation et transport : prévention de la dégradation, contrôle de la contamination.

    Chapitre 5 – Titrimétrie et méthodes colorimétriques

    La chimie classique retrouve son intérêt pour le dépistage rapide :

    Titrages : acido-basiques, rédox (permanganate, dichromate), précipitations (argent).

    Tests colorimétriques : Marquis, Duquenois-Levine pour drogues récréatives.

    Limites analytiques : sensibilité, interférences, spécificité.

    Applications historiques : premiers dépistages et évolutions vers l’instrumental.

    Chapitre 6 – Immuno-essais (ELISA)

    Les techniques immunologiques sont détaillées :

    Principe de l’ELISA : formats sandwich, compétition, direct et indirect.

    Performance : sensibilité, spécificité, seuils de détection.

    Interférences croisées : actions matricielles, anticorps non spécifiques.

    Automatisation et tests rapides : immunochromatographie (Tox-tab).

    Chapitre 7 – GC-MS (Chromatographie-spectrométrie de masse)

    La référence analytique pour de nombreux toxiques :

    Phase gazeuse : colonnes capillaires, choix de la phase stationnaire.

    Ionisation : électronique (EI) vs chimique (CI).

    Analyseurs : quadrupôle, TOF, haute résolution.

    Interprétation : spectres de fragmentation, bibliothèques (NIST).

    Chapitre 8 – HPLC et LC-MS

    Pour les composés polaires moins volatils :

    Colonnes : phase normale vs inverse, particules monodisperses

    Modes opératoires : isocratique, gradient

    Détecteurs : UV/PDA, spectrométrie de masse

    Préparation des échantillons : solid phase extraction (SPE), dérivatisation

    Chapitre 9 – Spectroscopies atomiques et moléculaires

    Mesure des métaux traces et caractérisation moléculaire :

    AAS (Absorption atomique) : flamme vs four graphite.

    ICP-MS : plasma induit, multi-élémentaire

    Spectroscopie UV-Vis/IR : bandes fonctionnelles, quantification

    AES (émission atomique) : sources d’excitation, plasma ; distinguer les lampes sources généralement utilisées en AAS.

    Chapitre 10 – Analyses post-mortem

    Spécificités de l’interprétation après décès :

    Redistribution post-mortem : phénomènes et modèles

    Choix des sites de prélèvement : fiabilité comparée (sang splanchnique vs périphérique)

    Doses létales : variabilité interindividuelle

    Exemples jurisprudentiels : analyses décisives en affaire criminelle

    Chapitre 11 – Toxicologie de la performance humaine
    Chapitre 12 – Validation de méthodes et statistique

    Garantir la fiabilité des résultats :

    Protocoles ISO 17025 : documentation, traçabilité

    Validation interne : linéarité, précision, exactitude

    Limites de détection et quantification : LOD/LOQ

    Analyse de l’incertitude : propagation d’erreur

    Chapitre 13 – Aspects légaux et éthiques

    Cadre juridique de la preuve toxicologique :

    Admissibilité : Daubert et Frye, exemples issus du droit américain, et non règles générales algériennes.

    Responsabilité de l’expert : impartialité, conflits d’intérêt

    Confidentialité et consentement : prélèvements, autopsies

    Éthique de la publication : transparence, reproductibilité

    Chapitre 14 – Études de cas et ateliers pratiques

    Application des connaissances à des scénarios réels :

    Dossier complet : de la scène à la cour (alcool mortel, surdosage médicamenteux)

    Rédaction de rapports d’expert : structure, clarté, références

    Simulations d’audience : témoignage, contre-interrogatoire

    Retour critique : analyse des points forts et limites des méthodes

    Évaluation

    Évaluation des effets comportementaux :

    Alcoolémie : modèle de Widmark, seuils légaux

    Drogues psychotropes : stimulants, dépresseurs, hallucinogènes

    Tests sur le terrain : sobriété, éthylotests électroniques

    Impacts médicaux et légaux : aptitude à conduire, travail en hauteur

    d) Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    e) Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  5. Atelier Biologie Forensique (02)
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 60h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 04h00Autres heures: 80h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

    Explorer la matière
    S3
    Atelier Biologie Forensique (02)

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Formation de premier cycle en chimie analytique ou en biologie (spectroscopie, chromatographie, biologie cellulaire).

    Objectifs

    Objectifs :

    Fournir aux participants les compétences pratiques et théoriques nécessaires pour conduire une enquête toxicologique complète, depuis la collecte et la préparation rigoureuse des échantillons biologiques jusqu’à l’interprétation et la présentation des résultats en justice.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 – Analyse capillaire et folliculaire

    Théorie : cinétique d’incorporation dans le cheveu, fenêtre de détection, facteurs de croissance.

    Démonstration : décontamination chimique, extraction par incubation acide/solvant, purification.

    TP : analyse par LC-MS/MS de cannabinoïdes et opiacés dans des mèches humaines simulées.

    Atelier 2– Redistribution post-mortem

    Principes : sites d’accumulation, gradient central-périphérique, facteurs influents (lipophilie, pH).

    Étude de cas : comparaison de concentrations de barbituriques dans sang cardiaque vs fémoral.

    Discussion : recommandations pour prélèvements (site, délai), impacts sur les rapports d’expertise.

    Atelier 3 – Cyanure et autres poisons volatils

    Théorie : toxicocinétique du cyanure, mécanisme d’action (inhibition cytochrome c oxidase).

    Démonstration : distillation alcaline, dérivatisation et mesure par GC-FID/MS.

    TP : échantillonnage de post-mortem (foie, sang), interprétation des résultats selon scenario incendie vs ingestion.

    Atelier 4 – Isotopes stables pour traçabilité

    Fondements : fractionnement isotopique, sources naturelles vs synthétiques.

    Démonstration : préparation d’échantillons, mesure par IRMS (Isotope Ratio MS).

    Étude de cas : différenciation de méthanol artisanal vs industriel, origine géographique de cocaïne.

    Atelier 5 – Méthodes avancées pour drogues de synthèse

    Théorie : défis analytiques des NPS (nouveaux psychotropes), métabolites, matrices complexes.

    Webinar/Démonstration : utilisation de HRAM (High Resolution Accurate Mass) et screening non ciblé.

    TP : analyse de panels simulés par LC-HRAM-MS, interprétation via bibliothèques spectra.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  6. Atelier d’Entomologie Forensique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

    Explorer la matière
    S3
    Atelier d’Entomologie Forensique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en Biologie générale et une familiarité avec les techniques d’extraction d’ADN et de PCR.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cet atelier d’Entomologie forensique a pour objectif de former les participants aux méthodes clés de la discipline : collecte et préservation rigoureuses des insectes sur une scène de crime, identification morphologique et moléculaire, modélisation du développement larvaire pour estimer l’intervalle post-mortem (PMI) et analyse entomotoxicologique — afin de produire des expertises scientifiquement solides et juridiquement recevables.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 : Collecte et préservation des insectes

    Techniques de capture : utilisation de filets à mailles fines, pièges « pup tent », balayages au filet et aspirateur à insectes.

    Préservation immédiate : immersion dans de l’éthanol 70 % vs congélation rapide, adaptation selon stade larvaire ou adulte.

    Fiches de terrain et Chain of Custody : étiquetage interne/externe, contremarques, conditions environnementales (T°, humidité, pH du sol)

    Atelier 2 : Élevage larvaire et modélisation thermique

    Montage expérimental : trois chambres climatiques à 15 °C, 25 °C et 35 °C avec larves de Calliphora vicina .

    Suivi des instars : mesures de longueur et diamètre toutes les 6 h, détermination des stades.

    Traitement statistique : calcul de la somme des degrés-jours et corrélation avec les âges larvaires observés.

    Atelier 3 : Identification morphologique et taxonomique

    Clés de détermination : observation des caractères diagnostiques (antenne, trompe, sculpture alaire) sous loupe binoculaire.

    Exercices de comparaison : mise en place de stations d’identification rapide pour 10 espèces courantes.

    Démonstration ADN : court protocole d’extraction larvaire et amplification du gène COI (barcoding) pour validation.

    Atelier 4 : Succession entomologique sur cadavre simulé

    Modèle de décomposition : utilisation de blocs de viande placés en plein air, relevés journaliers des communautés.

    Traitement des relevés : calcul des indices de diversité (Shannon, Simpson) et suivi des pics d’abondance des Diptera et Coleoptera .

    Interprétation : comparaison avec bases de données locales pour affiner le PMI.

    Atelier 5 : Entomotoxicologie

    Extraction : protocole de lyse enzymatique et purification SPE pour isoler composés lipophiles.

    GC–MS : paramètres chromatographiques (colonne, gradient, ionisation EI) et recherche dans bibliothèque NIST.

    Analyse : calcul de concentration larvaire, discussion de l’impact sur le développement entomologique et la reconstitution des circonstances du décès.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Compte rendu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  7. Anthropologie et victimologie criminelles
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Anthropologie et victimologie criminelles

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Biologie humaine, ainsi qu’une introduction aux méthodes qualitatives et quantitatives en sciences humaines

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Comprendre les fondements biologiques, sociaux et comportementaux du crime à travers l’anthropologie criminelle, tout en analysant les mécanismes de victimisation, la typologie des victimes et leur place dans le système judiciaire.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction générale au module

    Définitions des concepts clés : anthropologie criminelle, victimologie

    Origine et évolution des disciplines

    Intérêt et articulation dans le champ criminologique

    Chapitre 2 – Histoire de l’anthropologie criminelle

    De Cesare Lombroso aux approches modernes

    Anthropométrie, phrénologie, typologies physiques

    Évolutions critiques et dépassement des théories déterministes

    Chapitre 3 – Bases biologiques et comportementales de la criminalité

    Approches neurobiologiques, génétiques et hormonales

    Liens entre cerveau, impulsivité et violence

    Facteurs psychologiques et psychiatriques

    Chapitre 4 – L’anthropologie du passage à l’acte

    Processus de radicalisation criminelle

    Dimensions culturelles et rituelles du crime

    Crimes dans les sociétés traditionnelles vs modernes

    Chapitre 5 – Typologies des délinquants

    Délinquance juvénile, sexuelle, psychopathe, en col blanc

    Études de profils

    Aspects récurrents dans les parcours criminels

    Chapitre 6 – Fondements de la victimologie

    Naissance de la victimologie : Benjamin Mendelsohn, Hans von Hentig

    Évolution vers une science autonome

    Place de la victime dans le système judiciaire

    Chapitre 7 – Typologie des victimes

    Victimes primaires, secondaires, tertiaires

    Victimes vulnérables : enfants, femmes, personnes âgées

    Victimisation répétée et cumulée

    Chapitre 8 – Facteurs de vulnérabilité et risques victimaires

    Facteurs socio-économiques, environnementaux, comportementaux

    Victimes d’abus de pouvoir, de violence conjugale, de traite

    Liens avec les données épidémiologiques

    Chapitre 9 – Victime et agresseur : dynamiques relationnelles

    Notions d’interaction criminelle

    Théories de la provocation et de la responsabilité partagée

    Conséquences psychologiques sur les victimes

    Chapitre 10 – Prise en charge des victimes

    Accueil, écoute et accompagnement

    Rôle des services médico-judiciaires et des associations

    Réparation, indemnisation et justice restaurative

    Chapitre 11 – Études de cas et analyses intégrées

    Cas emblématiques de criminels étudiés en anthropologie

    Affaires réelles de victimisation analysées de façon interdisciplinaire

    Analyse comparative (victimes/criminels/société)

    Chapitre 12 – Approches actuelles et perspectives

    Apports des sciences forensiques et de la biologie

    Victimologie numérique et cybercriminalité

    Enjeux éthiques et place de la prévention

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  8. Droits de Propriété Intellectuelle
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Droits de Propriété Intellectuelle

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances de base en informatique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Fournir des connaissances de base sur les droits de propriété intellectuelle et leurs implications dans la recherche biologique et le développement de produits.

    Se familiariser avec la politique de l’Algérie en matière de DPI.

    Connaitre les différentes démarches pour le dépôt de brevet.

    Comprendre pourquoi l'Algérie a adopté une politique en matière de DPI et se familiariser avec les grandes lignes de la réglementation en matière de brevets.

    Comprendre les différents types de droits de propriété intellectuelle en général et la protection des produits issus de la recherche biotechnologique et les questions liées à la demande et à l'obtention de brevets.

    Programme

    Contenu de la matière

    1. brevetage d'une invention

    1.1. Introduction aux droits de propriété intellectuelle

    1.2. Formes de droits de propriété intellectuelle

    A. Propriété industrielle

    - Brevet

    - Conception

    - Marque déposée

    - Indications géographiques

    B. Propriété non industrielle

    - Copyright©

    2. Histoire et évolution du droit des brevets

    2.1. Évolution des lois sur les brevets

    2.2. Histoire du système algérien des brevets

    2.3. Conventions et traités internationaux

    2.4. Lois sur les brevets dans d'autres pays

    3. Classification des brevets

    3.1. Classification des brevets en Algérie

    3.2. Classification des brevets par l'OMPI

    3.3. Catégories de brevets

    3.4. Brevets spéciaux

    3.5. Brevets de produits biologiques

    4. Dispositions législatives générales pour les brevets en Algérie

    4.1. Brevetabilité : Que peut-on breveter ?

    4.2. Ce qui ne peut être breveté

    4.3. À qui appartient le droit au brevet ?

    4.4. Qu’est-ce qu’une invention de service ?

    4.5. Unité de l’invention

    4.6. Certificat d’addition

    5. Procédures de demande et de délivrance du brevet d’invention

    5.1. Dépôt

    5.2. Examen

    5.3. Délivrance

    5.4. Maintien de la validité du brevet

    6. Système national des brevets

    6.1. Qu’est-ce que l’Institut National Algérien de la Propriété Industrielle (INAPI) ?

    6.2. Formalités liées au dépôt d’une demande de brevet d’invention

    7. Procédures de dépôt d’une demande de brevet à l’étranger

    7.1. Comment protéger mon invention dans plusieurs pays ?

    7.2. Qu’est-ce que le Traité de coopération en matière de brevets PCT ?

    7.3. Quels sont les avantages du PCT ?

    7.4. Procédure de dépôt d’une demande internationale selon PCT

    8. Détenteur du brevet : droits et devoirs

    8.1. Propriété du brevet

    8.2. Droits du titulaire du brevet et des copropriétaires

    8.3. Obligations du titulaire du brevet et des copropriétaires

    8.4. Transfert des droits de brevet

    8.5. Limitations des droits de brevet

    8.6. Restauration des brevets

    8.7. Violation des droits de brevet et infractions

    8.8. Actions contre la contrefaçon : recours/recours

    9. Brevet de formes de vie

    14.1. Introduction

    14.2. Critères d'attribution du brevet

    14.2.1. Conditions préalables à la brevetabilité

    14.2.2. Exigences essentielles pour la brevetabilité

    14.3. Brevets de cellules et de lignées cellulaires

    14.4. Brevet des gènes et des séquences d'ADN

    14.4.1. Séquences utilisées pour les tests de diagnostic

    14.4.2. Séquences utilisées comme outils de recherche

    14.4.3. Séquences utilisées en thérapie génique

    14.4.4. Séquences utilisées dans la production de protéines thérapeutiques

    14.5. Brevets d'animaux

    14.6. Protection des obtentions végétales

    14.6.1. Brevets

    14.6.2. Formes sui generis de protection des obtentions végétales : Union Internationale pour la Protection des Obtentions Végétales (UPOV)

    14.6.3. Indications géographiques

    10. Brevets en biopharmacie

    10.1. Présentation

    10.2. Produits pharmaceutiques et biopharmaceutiques

    10.2.1. Différences entre les produits biologiques et les médicaments conventionnels

    10.2.2. Biosimilaires et produits biologiques « interchangeables »

    10.3. Nécessité d'une protection de la propriété intellectuelle des produits biopharmaceutiques

    10.4. Protection par brevet pour les produits biologiques

    10.4.1. Innovation incrémentale

    10.4.2. « Evergreening »

    10.5. Protection par brevet pour les diagnostics

    10.6. L'impact de la protection par brevet dans les tests génétiques

    10.7. Accords commerciaux internationaux sur les médicaments

    Évaluation

    Mode d’évaluation :

    Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)

    Castle, D. (Ed.). (2009). The role of intellectual property rights in biotechnology innovation. Edward Elgar Publishing.

    Ganguli, P. (2001). Intellectual Property Rights: Unleashing the Knowledge Economy. New Delhi: Tata McGraw-Hill Pub.

    Goel, D., & Parashar, S. (2013). IPR, Biosafety and Bioethics. Pearson Education India.

    Hennoun, M. La protection des droits de propriété intellectuelle et son incidence sur le développement en Algérie (Doctoral dissertation, Ecole Nationale Supérieure des Sciences Politiques).

    http://e-services.inapi.org/SITE/?Rub=Page&ID=1

    Lakhlef, S. (2016). Guide sur le Brevet D'invention _Procedures de dépôt en Algérie et à l'étranger.CENTRE DE RECHERCHE SUR L’INFORMATION SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE - CERIST

    Nambisan, P. (2017). An introduction to ethical, safety and intellectual property rights issues in biotechnology. Academic Press.

  9. Bio-programmation 1
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: TP / semaine: Autres heures: 10h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Bio-programmation 1

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Notions élémentaires d’algorithmique (facultatif)

    Savoir utiliser un ordinateur et naviguer dans un système de fichiers

    Des connaissances en informatique, bio-informatique, biologie moléculaire et en génétique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Initier les étudiants en biologie aux bases de la programmation en Python niveau 1, dans le but de les rendre capables de structurer un code simple, manipuler des données et automatiser des tâches basiques en lien avec leur domaine scientifique.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction à la programmation

    Qu’est-ce qu’un programme ? - Langages de programmation

    Pourquoi choisir Python en biologie ?

    Exemples d'applications en science

    Installation et prise en main

    Installation d’Anaconda

    Premier script Python

    Exécution de cellules, sauvegarde, commentaires

    Variables et types de données

    Types primitifs : int, float, str, bool

    Les tuples, les ensembles, les listes, les dictionnaires

    Opérateurs mathématiques et logiques

    Expression & les instructions de bases (lecture, écriture, affectation)

    Structures de contrôle

    Instructions conditionnelles : if, elif, else

    Opérateurs de comparaison

    Structures répétitives

    Boucles for et while

    Instructions break et continue

    Parcours de listes

    Fonctions

    Définir une fonction avec def

    Paramètres et valeurs de retour

    Fichiers

    7..1. Lire et écrire des fichiers .txt et .csv

    7.2. Méthodes open(), read(), write()

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  10. Anglais pour biologistes — niveau intermédiaire
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 5h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S3
    Anglais pour biologistes — niveau intermédiaire

    Repères

    Prérequis

    Connaissances élémentaires en anglais (niveau A2–B1).

    Maîtrise des bases de la grammaire anglaise (temps simples et structures de phrase).

    Objectifs

    Objectifs du cours

    Ce cours développe les compétences en anglais des étudiants (expression orale et écrite, compréhension orale et écrite) dans le contexte de la biologie criminalistique et des biotechnologies.

    À l’issue du cours, les étudiants doivent pouvoir :

    Comprendre et interpréter des textes scientifiques en biologie criminalistique et en biotechnologie.

    Communiquer efficacement dans des contextes scientifiques académiques et professionnels.

    Produire des écrits scientifiques et techniques structurés.

    Participer à des débats sur la bioéthique, les biotechnologies et l’innovation criminalistique.

    Programme

    Contenu du cours

    Unité 1 : Le monde scientifique et le travail dans les biotechnologies

    Grammaire : present perfect et révision des temps de base.

    Vocabulaire : métiers scientifiques et terminologie de l’emploi.

    Lecture : les métiers rêvés des biotechnologies et des sciences forensiques.

    Écoute : le rôle des biotechnologies dans les sciences forensiques.

    Expression orale : mon futur métier en biologie criminalistique.

    Écriture : rédiger une lettre de candidature pour un stage.

    Unité 2 : Biologie criminalistique et enquête criminelle

    Grammaire : auxiliaires do, be, have ; questions, négations et réponses courtes.

    Vocabulaire : preuves forensiques et traces biologiques.

    Lecture : les merveilles de la biologie criminalistique.

    Écoute : comment les cellules biologiques contribuent à résoudre des crimes.

    Expression orale : quiz de biologie et discussion d’une affaire criminelle.

    Écriture : correction d’erreurs et court paragraphe descriptif.

    Unité 3 : Bioéthique, biosûreté et responsabilité scientifique

    Grammaire : présent simple pour les faits scientifiques.

    Vocabulaire : données scientifiques et terminologie de la biosûreté.

    Lecture : la bioéthique dans les sciences forensiques.

    Écoute : la biosûreté dans les laboratoires forensiques.

    Expression orale : débat sur les questions éthiques en biologie criminalistique.

    Écriture : paragraphe scientifique mobilisant des données et le présent.

    Unité 4 : Preuves, traces et interprétation scientifique

    Grammaire : prétérit et expressions de quantité.

    Vocabulaire : échantillons biologiques, résidus, particules et traces.

    Lecture : comment les scientifiques reconstituent les scènes de crime.

    Écoute : résoudre les crimes à l’aide de preuves microscopiques.

    Expression orale : quelle quantité de preuves est suffisante ?

    Écriture : rapport scientifique décrivant les méthodes et les résultats.

    Unité 5 : Génie génétique et criminalistique moléculaire

    Grammaire : modaux could, might, must et should.

    Vocabulaire : outils d’analyse de l’ADN, modification génétique et génétique forensique.

    Lecture : CRISPR et les organismes génétiquement modifiés en sciences forensiques.

    Écoute : empreinte génétique obtenue à l’aide d’enzymes de restriction.

    Expression orale : débat sur les risques et les bénéfices du génie génétique.

    Écriture : paragraphe sur les usages détournés possibles des OGM dans des contextes criminels.

    Unité 6 : L’avenir des biotechnologies et l’innovation criminalistique

    Grammaire : formes du futur, conditionnels et propositions relatives.

    Vocabulaire : innovation, technologies forensiques et startups biotechnologiques.

    Lecture : CRISPR et les startups forensiques.

    Écoute : l’intelligence artificielle en criminalistique et ses frontières juridiques.

    Expression orale : le rôle futur du génie génétique dans les enquêtes criminelles.

    Écriture : courriel au maître de stage décrivant un projet de laboratoire forensique.

    Unité 7 : Biotechnologies appliquées à l’alimentation, à l’environnement et aux microalgues

    Grammaire : conditionnels et discours rapporté.

    Vocabulaire : enzymes, microalgues et applications biotechnologiques.

    Lecture : produits à forte valeur ajoutée issus des microalgues.

    Écoute : botanique forensique et affaires de criminalité environnementale.

    Expression orale : biotechnologies et prévention de la criminalité environnementale.

    Écriture : paragraphe scientifique utilisant les conditionnels et le discours rapporté.

    Évaluation

    Évaluation : contrôle continu 40 % ; examen final 60 %.

    Références

    Références : livres, polycopiés, sites internet, etc.

    Parasites et micro-organismes forensiques

    Analyses forensiques des produits alimentaires

    Médecine légale

    Bioinformatique

    Atelier de biologie forensique (03)

    Atelier de parasitologie et micro-organismes forensiques

    UE de découverte

    Lean Startup

    Biostatistiques

    UE transversale

    Bio-programmation 2

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Semestre 49 matières
  1. Parasites et micro-organismes Forensiques
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 55h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S4
    Parasites et micro-organismes Forensiques

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en Biologie cellulaire et moléculaire et en Microbiologie générale.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce cours vise à former des spécialistes capables d’identifier, de caractériser et d’interpréter la présence de parasites (protozoaires, helminthes, arthropodes) et de micro-organismes (bactéries, champignons, virus) dans un contexte médico-légal, en maîtrisant tant les aspects biologiques (cycle de vie, pathogénie, écodynamique) que les techniques modernes (PCR, séquençage haut débit, métagénomique).

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 - Généralités sur les parasites et leur intérêt en criminalistique

    1.1 Notion de parasite

    1.2 Grandes catégories de parasites

    1.3 Cycle de vie et intérêt indirect en criminalistique

    1.4 Parasites comme indicateurs biologiques

    1.5 Parasites et trace forensique (premier lien avec le module)

    1.6 Exemples simples (obligatoire pour compréhension)

    Chapitre 2 - Généralités sur les bactéries et leur rôle en criminalistique

    2.1 Notion de bactérie en contexte forensique

    2.2 Microbiome humain et environnemental

    2.3 Succession bactérienne

    2.4 Bactéries comme indicateurs forensiques

    2.5 Exemples simples

    Chapitre 3 - Généralités sur les champignons et leur intérêt forensique

    3.1 Introduction à la mycologie forensique

    3.2 Champignons et décomposition

    3.3 Champignons comme indicateurs environnementaux

    3.4 Applications criminalistiques

    3.5 Exemples simples

    Chapitre 4 - Généralités sur les virus et leur rôle en criminalistique

    4.1 Notion de virus

    4.2 Virus comme traces biologiques

    4.3 Virologie forensique

    4.4 Bioterrorisme (introduction)

    4.5 Exemples

    Chapitre 5 - Agents biologiques atypiques (prions et entités non conventionnelles)

    5.1 Introduction aux agents non classiques

    5.2 Prions

    5.3 Intérêt criminalistique

    5.4 Cas réels

    Chapitre 6 - Micro-organismes et environnement forensique

    6.1 Notion de microbiome environnemental

    6.2 Scène de crime comme écosystème

    6.3 Transfert microbien

    6.4 Applications

    Chapitre 7 - Applications globales en criminalistique

    7.1 Criminalistique humaine

    7.2 Criminalistique animale

    7.3 Criminalistique végétale

    7.4 Criminalité environnementale

    Chapitre 8 - Biocriminalité et bioterrorisme

    8.1 Notion de biocriminalité

    8.2 Agents biologiques dangereux

    8.3 Enquête biologique

    Chapitre 9 - Limites et interprétation des preuves biologiques

    9.1 Fiabilité des preuves biologiques

    9.2 Erreurs possibles

    9.3 Admissibilité judiciaire

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  2. Analyses Forensiques des Produits Alimentaires
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 55h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S4
    Analyses Forensiques des Produits Alimentaires

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Microbiologie alimentaire, Sécurité alimentaire, Chimie alimentaire, Réglementations alimentaires et systèmes de contrôle

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Au terme du cours, l'étudiant sera en mesure de maîtriser les diverses formes de criminalité alimentaire ainsi que leurs implications sur la santé publique et l'économie. Il saura analyser les méthodes de détection et de prévention de la fraude alimentaire, tout en développant des compétences en gestion des risques et en enquête alimentaire. De plus, il sera sensibilisé à l'importance de promouvoir la sécurité alimentaire et sera apte à participer activement à des campagnes de sensibilisation visant à informer et éduquer le public sur les pratiques alimentaires sûres.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction à la criminalité alimentaire

    Définitions : fraude alimentaire, falsification, adultération, tromperie.

    Différence entre non-conformité, infraction et fraude délibérée.

    Enjeux : santé publique, confiance des consommateurs, économie.

    Chapitre 2 – Histoire et émergence de la criminalité alimentaire

    Falsifications historiques (ex. : vin au plomb dans la Rome antique, lait à la mélamine).

    Grandes affaires récentes : viande de cheval, œufs contaminés au fipronil, huile frelatée.

    Influence de la mondialisation, industrialisation et logistique.

    Chapitre 3 – Typologies de fraudes alimentaires

    Substitution, dilution, falsification d’origine, addition d’additifs interdits.

    Falsification de dates de péremption, étiquetage frauduleux, fausses allégations santé.

    Contaminations volontaires vs involontaires.

    Chapitre 4 – Filière agroalimentaire et points de vulnérabilité

    Du champ à l’assiette : production, transformation, stockage, distribution.

    Chaînes longues vs courtes : où se glissent les fraudeurs ?

    Acteurs économiques impliqués et zones à risque.

    Chapitre 5 – Techniques de falsification alimentaire

    Falsifications courantes : ajout de colorants, substituts illégaux, dénaturation.

    Faux produits bio, halal, AOP, IGP.

    Cas spécifiques : huiles, vins, viande, miel, poissons, lait, épices.

    Chapitre 6 – Conséquences sanitaires des fraudes alimentaires

    Intoxications alimentaires, allergies, effets chroniques, cancérogénicité.

    Études de cas : aflatoxines, dioxines, métaux lourds, pesticides illicites.

    Populations vulnérables : enfants, femmes enceintes, immunodéprimés.

    Chapitre 7 – Techniques d’analyse et de détection en laboratoire

    Analyses physico-chimiques (GC-MS, HPLC, IR, RMN) et moléculaires (PCR). Précision : la PCR est une technique de biologie moléculaire.

    Détection d’ADN d’espèces (fraudes sur origine animale/végétale).

    Méthodes rapides (tests ELISA, chromatographie portable, capteurs).

    Chapitre 8 – Enquête criminalistique et traçabilité

    Constitution de la preuve : prélèvements, scellés, protocoles.

    Systèmes de traçabilité (code-barres, blockchain alimentaire).

    Rédaction du rapport expertal en cas de litige ou d’enquête.

    Chapitre 9 – Cadre réglementaire et juridique de la sécurité alimentaire

    Lois nationales et européennes (Règlement CE 178/2002, PAC, Codex Alimentarius). Ces textes et cadres sont de nature et de portée distinctes ; leur étude ne signifie pas leur application universelle.

    Responsabilités des industriels et distributeurs.

    Infractions et sanctions (pénales, civiles, administratives).

    Chapitre 10 – Contrôle officiel et rôle des autorités de surveillance

    Rôles de la DGCCRF, services vétérinaires, laboratoires de contrôle.

    Audit, inspection, échantillonnage ciblé.

    Cas de retrait, rappel, fermeture administrative.

    Chapitre 11 – Criminalité alimentaire et commerce international

    Règlementation à l’import/export.

    Marchés noirs agroalimentaires.

    Exemples de crises mondiales : contamination de riz, viande avariée exportée, faux miel chinois.

    Chapitre 12 – Criminalité alimentaire et criminalité organisée

    Mafias agroalimentaires (ex. : la mafia de la mozzarella, contrôle des marchés).

    Blanchiment d’argent via le commerce alimentaire.

    Enjeux géopolitiques et corruption.

    Chapitre 13 – Prévention et technologies de lutte contre la fraude

    Emballages intelligents, étiquettes inviolables, traçabilité numérique.

    Vérification de l’authenticité (spectrométrie, signatures chimiques).

    Innovation : IA, IoT, blockchain pour la sécurité alimentaire.

    Chapitre 14 – Rôle des professionnels et sensibilisation des consommateurs

    Devoirs des agriculteurs, transformateurs, distributeurs, restaurateurs.

    Éducation du consommateur : lecture d’étiquettes, détection de produits suspects.

    Associations de défense et lanceurs d’alerte.

    Chapitre 15 – Études de cas, simulations et projet de lutte intégrée

    Cas : lait frelaté en Chine, faux vins Bordeaux, saumon d’élevage trafiqué.

    Simulation d’une enquête sur un produit suspect.

    Élaboration d’un plan de prévention pour une entreprise agroalimentaire fictive.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  3. Médecine légale
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 55h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S4
    Médecine légale

    Repères

    Connaissances préalables recommandées :

    Connaissances de base en anatomie, biologie et notions générales de droit.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement :

    Ce module vise à initier les étudiants aux principes fondamentaux de la médecine légale, en leur fournissant les connaissances nécessaires pour comprendre l'intervention médico-légale dans le cadre judiciaire. Il aborde les pratiques d'autopsie, l'analyse des lésions, la détermination des causes de décès et la collaboration entre experts médicaux et autorités judiciaires.

    Programme

    Contenu de la matière

    Médecine légale générale

    Introduction

    Histoire de la médecine légale

    La médecine légale dans le monde

    Définition de la médecine légale

    Définition

    Les branches de la médecine légale

    La vocation de la médecine légale

    Rampart face au crime

    La recherche de la vérité

    Domaine d’application de la médecine légale

    Chez les personnes vivantes

    Urgences médico-judiciaires

    Dommages corporels

    Expertises en responsabilité (médicale, civile, pénale, etc.)

    Chez les personnes décédées

    La thanatologie : (autopsie, levée de corps etc.)

    L’identification :(anthropologie, génétique etc.)

    La toxicologie

    Le rôle du médecin légiste

    Le médecin légiste face à la société

    Le médecin légiste face à la justice

    La valeur de la preuve médico-légale

    Les différents types de preuves matérielles

    Les enjeux légaux et scientifiques relatifs aux preuves médico- légales

    Médecine légale spécialisée

    Introduction

    La médecine légale traumatologique

    Abrasion

    Contusions

    Plaies par armes blanches

    Plaies contuses

    Fractures

    Ecrasement

    Médecine légale infantile

    Maltraitance

    Infanticide

    Mort subite du nourrisson

    Médecine légale sexuelle

    Outrage public à la pudeur

    Attentat à la pudeur

    Attentat pédérastique

    Viol

    Perversions sexuelles

    Avortement

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  4. Bioinformatique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 55h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S4
    Bioinformatique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Connaissances de base en informatique, biologie moléculaire et en Biochimie.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L’objectif de ce cours est de fournir un enseignement théorique et pratique de l’usage des outils bioinformatiques et des bases de données spécifiquement appliqués à la biologie criminalistique, permettant de traiter et d’interpréter les données génétiques (STR, SNP, mtDNA) et protéiques issues de scènes de crime pour l’identification des individus, le profilage ADN, la reconstitution phylogénétique des souches pathogènes et la formulation de rapports d’expert.

    Programme

    Contenu de la matière :

    Programme des cours :

    Chapitre 1 – Fondamentaux et bases de données forensiques

    11 . Informatique en biologie criminalistique : applications (profilage ADN, traçabilité des souches bactériennes)

    Introduction à Unix/Linux : navigation, scriptage pour pipelines forensiques

    Concepts de bases de données : schéma relationnel, indexation, métadonnées d’échantillons

    Bases de données nucléotidiques et protéiques : GenBank, RefSeq, forensic STR database

    Bases structurales : PDB, structures de protéines pathogènes et antigènes

    Formats XML/DTD biologiques : formats d’échange (SBML, FASTA-XML)

    Algorithmes de correspondance de motifs : recherche de repeats courts (STR)

    Outils de recherche : BLAST, HMMER – contextes d’usage forensiques

    Identification protéique à partir d’ADN : traduction, cadre de lecture et analyse peptidique

    Recherche de séquences similaires : alignement local vs global, applications au génotypage

    Utilisation des portails NCBI : interface, GEO, SRA, ClinVar

    Outils publics et pipelines automatisés : Galaxy, Bioconda, Nextflow

    Ressources EBI : ENA, UniProtKB et africa forensic data

    Ressources web spécialisées : CODIS, Europol DNA databases

    Exploration de bases de données : filtres, requêtes SQL simples et BioPython

    Chapitre 2 – Analyse unitaire de séquences d’ADN criminelles

    Bases de données de gènes humains : STR loci, Y-STR, mito-DNA

    Soumission/recherche de séquences : dbSTR, YHRD

    Alignement de séquence : principes, scoring matrices adaptées (forensic match)

    Alignement pair-à-pair : BLASTn, Smith–Waterman pour profil STR

    Découverte de motifs STR : détection automatique de repeats, catalogage d’allèles

    Variants structurels locaux : indels, micro-variants STR et leur interprétation médico-légale

    Assemblage de génomes bactériens : suivi d’une contamination (salmonella, bacille)

    Chapitre 3 – Alignement multiple et phylogénétique forensique

    Alignements multiples : CLUSTAL Omega, MUSCLE appliqués aux séquences STR multi-locus

    Recherche flexible : FASTA3 pour divergences entre souches pathogènes

    CLUSTALW/CLUSTALX : interfaces graphiques pour experts forensiques

    Soumission de séquences alignées : SEQUIN, NCBI BankIt

    Mise à jour & annotation : versions, tracking des modifications

    Analyse phylogénétique : MEGA, construction d’arbres pour retracer source d’épidémie ou contamination croisée

    Interprétation génétique : bootstrap, distances génétiques, clusters forensiques

    Programme des Travaux Pratiques (5 ateliers)

    Recherche de séquences : BLASTn sur loci STR humains, interrogation de GenBank & ForenSTR.

    Conception d’amorces : Primer3 adapté aux courts repeats STR, vérification in silico des profils.

    Simulation PCR & clonage : SnapGene pour multiplex PCR STR, insertion de fragments dans vecteurs.

    Alignements : pair (BLAST) et multiple (CLUSTAL), analyse de profils ADN mixtes.Construction d’un arbre phylogénétique (outil : MEGA)

    Arbre phylogénétique & annotation : MEGA pour profilage de souches, Geneious pour annotation.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  5. Atelier Biologie Forensique 3
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 60h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 04h00Autres heures: 60h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

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    S4
    Atelier Biologie Forensique 3

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Les apprenants doivent avoir une bonne connaissance des bases en biologie moléculaire, microbiologie, toxicologie et droit sanitaire. Une familiarité avec les techniques de traçabilité (ADN, isotopie, profils microbiens) et les normes de sécurité alimentaire (HACCP, ISO, Codex Alimentarius) est souhaitable pour tirer pleinement parti de l’enseignement. Une culture générale sur les systèmes agroalimentaires et les mécanismes de contrôle qualité constitue également un atout.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module vise à sensibiliser les étudiants aux enjeux biologiques, juridiques et criminologiques liés aux fraudes et délits alimentaires. Il a pour but de former des professionnels capables d’identifier, d’analyser et d’interpréter des cas de falsification, de contamination volontaire ou accidentelle, de non-conformité sanitaire, ou de substitution frauduleuse dans les chaînes de production et de distribution alimentaires. L’approche est pluridisciplinaire : elle mobilise la biologie, la toxicologie, la traçabilité génétique, la microbiologie, la réglementation, et les outils d’enquête forensique. À l’issue du module, les étudiants seront capables de participer à une expertise en cas d’infraction alimentaire, de mener une investigation scientifique et de produire un rapport circonstancié.

    Programme

    Contenu de la matière

    Ateliers 1 : Détection d’adultération dans les produits alimentaires (miel, lait, huile)

    Tests d’authenticité du miel (solubilité, test à la chaleur, test à l’eau).

    Détection de l’ajout d’amidon ou d’eau dans le lait.

    Analyse de l’indice de peroxyde et d’acidité pour l’huile d’olive.

    Interprétation en lien avec les pratiques frauduleuses.

    Atelier 2 : Isolement et identification de micro-organismes pathogènes dans des échantillons alimentaires

    Ensemencement de lait, viande ou jus sur milieux sélectifs (Salmonella, E. coli, Listeria).

    Incubation, observation des colonies, coloration de Gram.

    Interprétation microbiologique dans un contexte d’intoxication alimentaire.

    Atelier 3 : Recherche de contaminants chimiques (pesticides, métaux lourds) dans les denrées alimentaires

    Extraction de contaminants à partir de fruits, légumes ou céréales.

    Détection qualitative de pesticides (ex : chromatographie sur couche mince – CCM).

    Tests colorimétriques pour les métaux lourds (plomb, mercure).

    Mise en lien avec la réglementation en vigueur.

    Atelier 4 : Détection de viande frauduleuse par PCR (traçabilité ADN)

    Extraction de l’ADN à partir d’échantillons de viande.

    Amplification PCR avec amorces spécifiques (bœuf, cheval, porc, etc.).

    Visualisation des produits par électrophorèse.

    Interprétation des résultats dans un contexte d’étiquetage frauduleux.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  6. Ateliers Parasites et micro-organismes Forensiques
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

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    S4
    Ateliers Parasites et micro-organismes Forensiques

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Une connaissance de base en microbiologie, parasitologie et biologie moléculaire est requise. Les étudiants doivent maîtriser les fondamentaux de la microscopie optique, les notions de cycle parasitaire, ainsi que les principes de la PCR et de la culture microbienne. Une sensibilisation préalable à la démarche criminalistique ou médico-légale est également souhaitée pour mieux contextualiser les travaux pratiques proposés.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cet atelier a pour objectif d’initier les apprenants aux méthodes d’analyse parasitologique et microbiologique appliquées aux sciences forensiques. Il vise à développer des compétences pratiques dans la détection, l’identification morphologique et moléculaire de parasites et de micro-organismes d’intérêt médico-légal, ainsi qu’à interpréter leur rôle dans le cadre d’une enquête criminelle ou sanitaire. Les apprenants apprendront à mobiliser ces connaissances dans des contextes variés : estimation du temps de mort, traçabilité environnementale, suspicion de biocriminalité, maltraitance ou intoxication parasitaire.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 – Identification morphologique des parasites d’intérêt forensique

    Atelier 2 – Micro-organismes bactériens dans les scènes criminelles

    Atelier 3 – Fongiques Forensiques : les champignons comme traceurs biologiques

    Atelier 4 – Techniques moléculaires appliquées à la parasitologie et à la mycologie forensique

    Atelier 5 – Diagnostic comparatif sur scène simulée

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  7. Lean Startup
    3 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: 01h30Autres heures: 20h00

    Évaluation: contrôle continu 80% · examen 20%

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    S4
    Lean Startup

    Repères

    Connaissances préalables recommandée

    Les étudiants sont censés posséder des connaissances préalables dans les domaines suivants :

    Les fondamentaux de l’entrepreneuriat.

    Les bases de la gestion de projet.

    Les concepts liés à l’innovation et au développement technologique.

    La méthodologie générale de recherche.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce cours se concentre sur l’étude des concepts, méthodes et outils associés à la méthodologie du Lean Startup. Il met l’accent sur les mécanismes de création d’entreprises innovantes dans des environnements caractérisés par un haut niveau d’incertitude, à travers l’expérimentation, l’apprentissage rapide et la validation continue des hypothèses.

    À l’issue de ce module, les étudiants seront capables de :

    Comprendre les principes fondamentaux et la philosophie de la méthodologie Lean Startup.

    Transformer une idée innovante ou un résultat de recherche en un projet d’entreprise viable.

    Formuler et tester les hypothèses clés sous-jacentes à un projet entrepreneurial.

    Concevoir et développer un Produit Minimum Viable (MVP).

    Analyser les données du marché et prendre des décisions d’affaires éclairées.

    Aligner l’innovation et la recherche scientifique avec les besoins du marché et les attentes des clients.

    Le module adopte des approches pédagogiques modernes, notamment :

    L’apprentissage par projet (Project-Based Learning – PBL).

    L’apprentissage expérientiel.

    Le travail en équipe pluridisciplinaire.

    La simulation d’un écosystème de startup.

    L’apprentissage basé sur la résolution de problèmes.

    Programme

    Contenu de la matière

    I- Cours magistraux

    L’université entrepreneuriale et l’Université 4.0

    Évolution des universités de 1.0 à 4.0

    Caractéristiques de l’Université 4.0

    Transformation numérique et intelligence artificielle dans l’enseignement supérieur

    Rôle des universités dans l’économie de la connaissance

    Valorisation de la recherche scientifique

    Transformation des résultats de recherche en startups

    Les universités comme moteurs de l’innovation et du développement économique

    Exemples internationaux d’universités entrepreneuriales : Massachusetts Institute of Technology (MIT), Stanford, Cambridge, Tsinghua, National University of Singapore (NUS), Technical University of Munich (TUM) et PSL University/Polytechnique (France) PSL et École Polytechnique sont des établissements distincts.

    Écosystème de l’entrepreneuriat et de l’innovation en Algérie et à l’université

    Définition de l’écosystème entrepreneurial

    Acteurs clés de l’écosystème

    Politique algérienne de soutien à l’innovation

    Incubateurs et accélérateurs

    Fonds d’investissement

    Décision ministérielle 1275 (startups, micro-entreprises, brevets)

    Incubateurs universitaires et centres de soutien technologique

    Rôle de l’intelligence artificielle dans l’écosystème

    Liaison entre l’université et l’environnement économique

    Introduction aux startups et à la méthodologie Lean Startup

    Différence entre entreprises traditionnelles et startups

    Concept d’innovation

    Incertitude dans les projets entrepreneuriaux

    Origines de l’approche Lean Startup

    Principes fondamentaux de la méthodologie

    Apprentissage validé (Validated Learning)

    Réduction du gaspillage

    Cycle Construire–Mesurer–Apprendre (Build–Measure–Learn)

    Comptabilité de l’innovation (Innovation Accounting)

    Différence entre comptabilité traditionnelle et comptabilité de l’innovation

    Mesure de la progression en contexte d’incertitude

    Indicateurs d’apprentissage plutôt que d’indicateurs de profit

    Compréhension du marché et découverte client

    Étapes de création d’une startup : idée, équipe, prototype, investissement

    Méthodologie de Steve Blank

    Customer Development : compréhension du marché et du comportement des clients

    Identification des problèmes

    Analyse des besoins des clients

    Entretiens entrepreneuriaux

    Construction d’hypothèses

    Problem–Solution Fit (adéquation problème–solution)

    Business Model Canvas

    Concept du Business Model Canvas

    Proposition de valeur

    Segments de clients

    Canaux de distribution

    Flux de revenus

    Structure financière / structure de coûts

    Produit Minimum Viable (MVP)

    Concept du MVP

    Types de MVP : numérique, expérimental, service, fake-door

    Test des hypothèses

    Prototypage rapide

    Outils de développement de prototypes

    MVP numériques et industriels

    Comment mesurer l’échec dans le délai le plus court possible

    Intelligence artificielle et TRIZ pour l’innovation

    Intelligence artificielle dans l’entrepreneuriat

    Génération d’idées

    Analyse de marché

    Développement de MVP

    Marketing intelligent

    Méthodologie TRIZ

    Contradictions techniques

    Résultat final idéal (Ideal Final Result)

    Combinaison de l’IA avec TRIZ

    Startups Deep Tech

    Mesure, analytique et gestion de l’échec

    KPI (indicateurs clés de performance)

    Gestion des startups

    Leadership des équipes d’innovation

    Concepts de mesure de la croissance des startups

    Métriques AARRR : méthode d’évaluation du développement des startups en cinq étapes :

    Acquisition : comment atteignons-nous et attirons-nous les clients ?

    Activation : l’utilisateur essaie-t-il le produit pour la première fois ?

    Retention (rétention) : les utilisateurs reviennent-ils utiliser le produit ?

    Revenu : le projet génère-t-il des revenus ? Distinguer le chiffre d’affaires du profit.

    Referral (recommandation) : les utilisateurs recommandent-ils le produit à d’autres ?

    Pivot ou persévérer

    Concept de pivot : changement stratégique partiel ou complet

    Concept de persévérer : continuer dans la direction actuelle

    Quand faut-il changer de direction ?

    Types de pivot

    Indicateurs de prise de décision

    Financement, croissance et mise à l’échelle

    Financement initial

    Autofinancement / bootstrapping

    Investisseurs

    Investisseurs providentiels (business angels)

    Capital-risque (venture capital)

    Financement participatif (crowdfunding)

    Étapes de financement

    Growth hacking

    Moteurs de croissance (engines of growth)

    II- Séances pratiques :

    1 - L’université entrepreneuriale et l’Université 4.0

    Étude de cas : pourquoi le MIT a réussi à créer des milliers de startups ?

    Les étudiants réalisent une analyse :

    La relation entre la recherche scientifique et l’innovation

    Le rôle des séminaires et des accélérateurs

    Les mécanismes de valorisation de l’innovation

    La contribution de l’université dans l’économie locale

    Travail demandé :

    Identifier les éléments du modèle de l’université entrepreneuriale

    Comparer les universités algériennes avec le MIT

    Proposer un plan de transformation d’une université algérienne vers une Université 4.0

    Atelier : Conception d’une Université Algérienne 4.0

    Les étudiants sont répartis en équipes.

    Chaque équipe conçoit :

    un centre d’innovation

    un incubateur d’entreprises

    un accélérateur de projets

    un centre de soutien technologique et d’innovation

    une entreprise filiale

    un fonds d’investissement universitaire

    Puis, les étudiants présentent un plan organisationnel intégré et cohérent, représentant une feuille de route complète pour une Université 4.0.

    2 - Étude de cas : parcours d’une startup algérienne

    Sélectionner une startup algérienne ayant obtenu le label startup ;

    Travail demandé :

    Analyser les parties prenantes impliquées et leur rôle

    Identifier les sources de financement

    Représenter la cartographie du système environnemental (écosystème)

    Proposer des outils pour accélérer sa croissance

    Atelier : cartographie de l’écosystème entrepreneurial à l’aide de Miro ou Canva,

    L’objectif est de permettre aux étudiants de comprendre les différents acteurs impliqués dans l’écosystème entrepreneurial et d’analyser leurs interactions.

    Qu’est-ce que la cartographie de l’écosystème entrepreneurial ?

    Il s’agit d’une représentation visuelle du système environnemental dans lequel une startup se crée, se développe et évolue.

    Cette cartographie permet de montrer les différentes parties prenantes impliquées dans la création, le développement et l’accompagnement des projets entrepreneuriaux, ainsi que les relations et interactions entre elles.

    Étape 1 : Identification des acteurs

    Les étudiants doivent identifier les principaux acteurs présents dans l’écosystème, par exemple :

    Universités et établissements de recherche

    Incubateurs universitaires

    Accélérateurs de startups

    Entreprises et industriels

    Institutions économiques et financières

    Banques

    Agences gouvernementales

    Startups et porteurs de projets

    Étape 2 : Organisation des acteurs en groupes

    Il est possible de structurer les acteurs de l’écosystème en plusieurs catégories.

    1. Axe de Production de la connaissance

    Universités

    Centres de recherche

    Laboratoires scientifiques

    2. Axe de formation, d’accompagnement et de soutien

    Incubateurs

    Accélérateurs de startups

    Centres de soutien à l’entrepreneuriat

    3. Axe de financement

    Business angels (investisseurs providentiels)

    Fonds d’investissement

    Banques

    4. Axe du marché

    Institutions économiques

    Clients

    Partenaires industriels

    5. Axe de régulation et d’organisation

    Ministères

    Instances gouvernementales

    Agences nationales

    Étape 3 : Création de la cartographie de l’écosystème

    À l’aide de Miro ou Canva

    Travail demandé :

    Placer « l’entreprise innovante » au centre de la carte

    Positionner les autres acteurs autour

    Représenter la nature des relations entre les acteurs

    Exemple de structuration :

    Université → recherche → entreprise

    Incubateur → accompagnement → startup

    Investisseur → financement → entreprise

    Institution économique / entreprise → marché

    Étape 4 : analyse des relations

    Chaque équipe doit répondre aux questions suivantes :

    Qui sont les acteurs clés dans la réussite d’une startup ?

    Quelles sont les relations manquantes dans l’écosystème ?

    Comment renforcer la coopération entre universités et entreprises ?

    Quels sont les obstacles rencontrés par les startups dans cet écosystème ?

    Fin de la séance (atelier)

    Chaque groupe doit présenter :

    une carte de l’écosystème entrepreneurial

    une explication des relations entre les acteurs

    des propositions pour améliorer l’écosystème entrepreneurial en Algérie

    Cet atelier ne vise pas uniquement à développer la connaissance théorique des acteurs de l’écosystème entrepreneurial, mais aussi à permettre aux étudiants de comprendre la réussite d’une startup en tant que système global.

    L’idée est que la startup ne repose pas uniquement sur une idée, mais sur un réseau complet d’acteurs et de relations au sein de l’écosystème entrepreneurial.

    Les étudiants doivent construire :

    une cartographie des incubateurs

    une cartographie des investisseurs

    une cartographie des universités

    une cartographie des instances gouvernementales

    une représentation des relations entre ces acteurs

    3 - Étude de cas : échec d’une startup technologique

    Une startup a développé un produit complet sans validation préalable du besoin du marché.

    Travail demandé :

    Identifier les erreurs commises

    Analyser les sources de gaspillage (waste)

    Proposer une application de la méthodologie Lean Startup

    Construire une version alternative du cycle Build–Measure–Learn

    Atelier : analyse du cas Dropbox

    Avant de développer le produit complet, l’entreprise a validé la demande du marché à travers une vidéo explicative simple.

    Travail demandé :

    Identifier les hypothèses de départ

    Analyser le mécanisme de validation

    Comparer le coût de l’expérimentation avec celui du développement complet d’un produit

    4 - Étude de cas : plateforme d’intelligence artificielle pour les étudiants

    L’équipe pédagogique estime que les étudiants ont besoin d’une plateforme d’assistance académique.

    Travail demandé :

    Formuler 10 hypothèses

    Préparer un guide d’entretien

    Réaliser 20 entretiens terrain

    Extraire les problèmes réels

    Atelier : entretiens entrepreneuriaux

    Simulation d’entretiens

    Les étudiants jouent différents rôles :

    entrepreneur

    client potentiel

    investisseur

    Travail demandé :

    poser des questions pertinentes

    simuler des échanges réalistes

    analyser les réponses obtenues

    5 - Étude de cas : une startup dans le domaine de la santé numérique

    Fournir des consultations médicales à distance

    Travail demandé :

    Élaborer un modèle d’affaires complet incluant :

    la valeur proposée

    les clients

    les revenus

    les partenaires

    Atelier :

    Défi de 60 minutes

    Chaque équipe présente un projet différent

    Création d’un Business Model Canvas complet

    Défense du projet devant un jury d’évaluation

    6 - Étude de cas : application de validation intelligente

    Défi d’équipe à ressources limitées

    Travail demandé :

    Concevoir un MVP à moindre coût

    Identifier les hypothèses critiques à tester

    Choisir le type de MVP le plus approprié

    Définir des indicateurs de succès et d’échec

    Atelier : construction d’un MVP réel

    Les étudiants construisent un MVP fonctionnel à l’aide des outils suivants :

    Figma

    Glide

    Bubble

    Canvas

    Les étudiants doivent développer un prototype initial pendant la séance ou le terminer à domicile.

    7 - Étude de cas : startup d’agriculture intelligente

    Augmentation de la production agricole tout en réduisant la consommation d’eau.

    Travail demandé :

    Identifier la contradiction technique

    Appliquer les principes de la méthode TRIZ

    Utiliser des outils d’intelligence artificielle (assistants d’IA générative) pour générer des solutions

    Évaluer les solutions proposées

    Atelier : AI Innovation Sprint

    Durée : 90 minutes

    Travail des étudiants :

    Générer une idée innovante

    Définir un MVP

    Construire un modèle d’affaires

    Utiliser uniquement des outils d’intelligence artificielle pour la génération d’idées

    8 - Étude de cas : plateforme d’e-learning

    Données :

    10 000 visites

    1 000 inscriptions

    400 utilisateurs actifs

    40 clients payants

    Travail demandé :

    Calculer les indicateurs AARRR disponibles et identifier les données manquantes de rétention, recommandation et revenus.

    Identifier le point de blocage principal

    Proposer des solutions d’amélioration

    Évaluer les signes d’adéquation produit–marché sans considérer ces seuls effectifs comme une preuve suffisante.

    Atelier : tableau de bord startup

    Les étudiants doivent construire un dashboard incluant :

    Acquisition

    Activation

    Rétention

    Revenus

    Recommandation

    Burn Rate

    Travail demandé :

    interpréter les résultats

    expliquer les forces et faiblesses du projet

    proposer des actions correctives

    9 - Étude de cas : Instagram

    Analyse de la transition Burbn → Instagram

    Travail demandé :

    Identifier la raison du pivot

    Identifier les données ayant soutenu la décision

    Analyser les résultats obtenus

    Proposer des alternatives stratégiques possibles

    Atelier : simulation de conseil stratégique

    Les étudiants simulent une réunion de comité de direction et analysent un dossier de startup incluant :

    indicateurs de performance

    avis clients

    données financières

    Les étudiants doivent prendre une décision collective :

    Pivot

    Persevere (persévérer)

    Kill Project (arrêter le projet)

    Toute décision doit être argumentée à l’aide de données et de statistiques.

    10 -Projet semestriel : Startup Lab

    Le projet pratique de fin de semestre s’étend sur toute la durée du module.

    Il comprend :

    Identification d’un problème réel

    Customer Discovery (découverte client)

    Business Model Canvas

    Conception d’un MVP

    Utilisation des outils IA et TRIZ

    Analyse et mesure des résultats

    Décision Pivot / Persevere

    Plan de financement et de croissance

    Présentation finale (Pitch)

    Section supplémentaire présente dans le source : éthique et professionnalisme en psychologie criminelle

    Normes éthiques dans la pratique

    Responsabilités professionnelles

    Limites et controverses

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 80 % ; Examen : 20 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc

    The Lean Startup, 2011, Eric Ries

    The Startup Owner’s Manual, 2012, Steve Blank, Bob Dorf

    Running Lean, 2012, Ash Maurya

    Business Model Generation, 2010, Alexander Osterwalder, Yves Pigneur

    Value Proposition Design, 2014, Alexander Osterwalder, Yves Pigneur, Gregory Bernarda, Alan Smith

    Traction: How Any Startup Can Achieve Explosive Customer Growth, 2015, Gabriel Weinberg, Justin Mares

    Hooked: How to Build Habit-Forming Products, 2014, Nir Eyal

    Lean Analytics, 2013, Alistair Croll, Benjamin Yoskovitz

    Measure What Matters, 2017, John Doerr

    High Output Management, 1983, Andrew S. Grove

    The Hard Thing About Hard Things, 2014, Ben Horowitz

    Prediction Machines: The Simple Economics of Artificial Intelligence, 2018, Ajay Agrawal, Joshua Gans, Avi Goldfarb

    Competing in the Age of AI, 2020, Marco Iansiti, Karim R. Lakhani

    The Innovation Algorithm: TRIZ, Systematic Innovation and Technical Creativity, 1999, Genrich Altshuller

    TRIZ: The Theory of Inventive Problem Solving, 2003, Sergei Ikovenko

    Why the Lean Start-Up Changes Everything, 2013, Steve Blank

    Do Things That Don’t Scale, 2013, Paul Graham

    Startup Playbook, 2018, Y Combinator

    The State of AI in Business, 2023, McKinsey Global Institute

    Artificial Intelligence Index Report, 2024, Stanford University

    OECD Entrepreneurship and Innovation Policy Frameworks, 2022, OECD

  8. Biostatistique
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S4
    Biostatistique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    En mathématique, en informatique et en biostatistique

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L'objectif de cette matière est d'initier les étudiants aux méthodes statistiques et de comprendre les principes sous-jacents, ainsi que des directives pratiques de « comment le faire » et « comment l'interpréter » des données statistiques en particulier pour les biosystèmes. A l'issue de ce cours, les étudiants doivent être capables de :

    Comprendre comment résumer des données statistiques.

    Appliquer des tests statistiques appropriés basés sur une compréhension de la question de l'étude, du type d'étude et du type de données.

    Interpréter les résultats des tests statistiques et leur application dans les systèmes biologiques.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction : Bienvenu à l’univers R

    Installation du logiciel

    Principes de base de l'utilisation de R

    Calcul de la moyenne et des écart-types

    Analyse de la corrélation et de la régression

    Représentations graphiques

    Analyse de la variance (un facteur et deux facteurs) et de la covariance

    Tests statistiques

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  9. Bio-programmation 2
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: TP / semaine: Autres heures: 10h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S4
    Bio-programmation 2

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Maîtrise des concepts de base de Python niveau 1.

    Familiarité avec un environnement de développement (IDE comme PyCharm ou Jupyter).

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L’objectif de cet enseignement est de consolider les bases de la programmation en Python, en révisant l’utilisation des variables, boucles, fonctions et fichiers, tout en initiant les étudiants à l’usage des bibliothèques scientifiques telles que NumPy, Pandas et Matplotlib appliquées aux problématiques biologiques. Il vise également à développer l’autonomie dans l’installation et l’importation de bibliothèques via Anaconda, à familiariser les étudiants avec les outils bio-informatiques et à les amener à réaliser un projet d’analyse ou de simulation.

    Programme

    Contenu de la matière

    Manipulation de données avec NumPy

    Utiliser des tableaux NumPy pour représenter des données biologiques (séquences, matrices).

    Appliquer des opérations vectorielles et le slicing pour l’analyse de données.

    Analyse de données biologiques avec Pandas

    Lire et manipuler des fichiers CSV (ex : résultats PCR, dosages enzymatiques).

    Trier, filtrer et regrouper des données pour l’analyse expérimentale.

    Visualisation des données avec Matplotlib

    Créer des graphiques (courbes, histogrammes) pour présenter des résultats biologiques.

    Personnaliser des visualisations (titres, légendes, étiquettes).

    Programmation Orientée Objet (POO)

    Concepts fondamentaux (Comprendre les classes, objets, attributs et méthodes. Implémenter une classe simple.

    Héritage et méthodes spéciales.

    Introduction à Biopython

    Lire et analyser des fichiers FASTA.

    Extraire des informations de séquences ADN (longueur, contenu).

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.

    Génétique Moléculaire des Pathologies Humaines

    Criminalité pharmaceutique

    Expertise des Traces Physiques : Empreintes, Balistique & Micro‑traces

    Cybercriminalité

    Atelier Biologie Forensique (04)

    Atelier Génétique Moléculaire des Pathologies Humaines

    UE découverte

    Psychologie Criminelle

    Ingénierie inversée

    UE transversale

    English for Biologists – Advanced

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Semestre 59 matières
  1. Génétique Moléculaire des Pathologies Humaines
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 70h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S5
    Génétique Moléculaire des Pathologies Humaines

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Bases en biologie cellulaire, génétique classique et techniques de biologie moléculaire.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce cours vise à fournir une compréhension approfondie des mutations génétiques, des modes de transmission héréditaire et des mécanismes moléculaires des maladies génétiques. Il met en lumière les facteurs influençant l’expression des gènes, comme la pénétrance, l’expressivité variable et l’épigénétique, tout en soulignant leurs applications en biologie criminalistique. Les étudiants apprendront les techniques de détection des altérations génétiques, ainsi que les aspects éthiques et juridiques liés à l’utilisation des données génétiques dans le contexte médico-légal.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Fondements des mutations génétiques et transmission des pathologies humaines

    Les types de mutations à l’origine des pathologies génétiques humaines

    Altérations génétiques fines

    Mutations ponctuelles

    Substitutions : transition, transversion

    Effets : faux-sens, non-sens, silencieuses

    Insertions et délétions (indels) et ses conséquences

    Mutations affectant l'épissage et des conséquences sur l’ARNm et la synthèse protéique

    Anomalies chromosomiques

    Anomalies de nombre

    Anomalies de structure

    Techniques de détection : caryotype, FISH, CGH-array

    Origine des mutations génétiques

    Mutations innées (constitutionnelles)

    Mutations acquises

    Mutations de novo

    Modes de transmission des maladies génétiques

    Transmission mendélienne classique

    Autosomique dominante

    Chorée de Huntington

    Syndrome de Marfan

    Autosomique récessive

    Mucoviscidose

    Phénylcétonurie

    Transmission liée à l’X

    Récessive : hémophilie, DMD, daltonisme

    Dominante : rachitisme héréditaire cité. Le syndrome d’Alport, également cité, présente plusieurs modes de transmission : lié à l’X, autosomique dominant ou récessif.

    Transmission mitochondriale

    Neuropathie optique de Leber

    Modes de transmission particuliers

    Codominance

    Empreinte parentale

    Disomie uniparentale

    Chapitre 2 : Les concepts modulant l’expression des maladies

    Pénétrance

    Définition

    Types de pénétrance

    Pénétrance complète

    Pénétrance incomplète

    Facteurs influents

    Environnement,

    Épigénétique

    Expressivité variable

    Variabilité des signes cliniques entre individus porteurs de la même mutation

    Exemple : neurofibromatose de type 1

    Maladies multifactorielles

    Interaction entre génome et environnement

    Diabète, schizophrénie, obésité, maladies auto-immunes

    Maladies d’apparition tardive

    Chapitre 3 : Approches moléculaires des pathologies et leur application en criminalistique

    Épigénétique et pathologies

    Principes de l’épigénétique

    Mécanismes : méthylation de l'ADN, modifications des histones, ARN non codants

    Impact de l’épigénétique sur les pathologies humaines

    Influence de l’environnement (stress, alimentation, pollution) sur l'expression des gènes

    Épigénétique et comportements criminels : étude critique des associations et des limites de l’inférence causale.

    Associations étudiées entre épigénétique et comportements violents ou antisociaux, sans déterminisme biologique.

    Études sur la relation entre traumatismes, stress post-traumatique et comportements criminels

    Oncologie moléculaire et génétique du cancer

    Bases moléculaires de l'oncogenèse

    Mutations activatrices et inactivatrices : oncogènes et gènes suppresseurs de tumeurs

    Instabilité génomique : rôle des anomalies chromosomiques dans le développement des cancers

    Oncogénétique et identification des causes de décès suspectes

    Pharmacogénétique et médecine légale

    Principes de la pharmacogénétique

    Variabilité interindividuelle dans la réponse aux médicaments

    Étude des polymorphismes des gènes impliqués dans la réponse aux traitements médicamenteux

    Pharmacogénétique et criminologie

    Compréhension des effets des médicaments sur les comportements dans les enquêtes criminelles (empoisonnement ou surdosage)

    Évaluer les risques de réactions extrêmes aux traitements et leurs effets comportementaux possibles ; une susceptibilité génétique ne démontre pas un comportement criminel.

    Génétique moléculaire des pathologies humaines et la biologie criminalistique

    Amélioration de l'identification des suspects et des victimes

    Étude des comportements criminels et des troubles mentaux, dans les limites de l’inférence génétique.

    Chapitre 4 : Méthodes d’exploration des lésions géniques et chromosomiques

    Techniques classiques

    PCR, qPCR, PCR, séquençage Sanger

    Blots (Southern, Northern)

    Technologies avancées

    NGS : WGS, WES, panels ciblés, Puces à ADN

    RNA-seq pour les troubles d’expression

    CGH-array et FISH pour anomalies chromosomiques

    Interprétation bio-informatique

    Bases de données : ClinVar, HGMD, GnomAD

    Outils prédictifs : SIFT, PolyPhen, MutationTaster

    Chapitre 5 : Implications éthiques et juridiques des données génétiques

    Diagnostic prénatal et postnatal : impact éthique et sociétal

    Confidentialité et gestion des données génétiques

    Génétique et responsabilité pénale

    Influence des troubles génétiques sur les comportements

    Dérives possibles de l’argument "gène du crime"

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc)
  2. Criminalité pharmaceutique
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S5
    Criminalité pharmaceutique

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Pharmacologie générale, Législation pharmaceutique, Chimie organique, Criminalistique

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce cours aura pour objectifs, entre autres, d’initier l’étudiant aux principales infractions en rapport avec les produits pharmaceutiques et médicamenteux : malfaçon ; contrefaçon ; non-conformité ; vente illicite de produits médicamenteux ; falsification de documents sanitaires.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction générale à la criminalité pharmaceutique

    Définitions fondamentales : contrefaçon, falsification, sous-standard, médicament illicite.

    Criminalité pharmaceutique vs criminalité organisée.

    Présentation des enjeux sanitaires, économiques, géopolitiques et éthiques.

    Chapitre 2 – Histoire et émergence du phénomène

    Grands scandales historiques (ex. : Elixir Sulfanilamide, sirop de paracétamol frelaté).

    Évolution des trafics pharmaceutiques avec la mondialisation.

    Études de cas marquants en Afrique, Asie et Europe.

    Chapitre 3 – La chaîne du médicament : étapes légales et failles exploitées

    Fabrication, distribution, dispensation : les circuits officiels.

    Points vulnérables à l'infiltration criminelle.

    Le rôle des marchés parallèles et du e-commerce.

    Chapitre 4 – Typologies et formes de médicaments falsifiés

    Classification selon la nature de la fraude : absence de PA, dosage incorrect, mauvais excipients, etc.

    Différence entre génériques et contrefaçons.

    Profils types : médicaments falsifiés dans l’oncologie, infectiologie, cardiologie.

    Chapitre 5 – Techniques de falsification et circuits de production illicites

    Moyens employés pour imiter les produits : emballage, marquage, formulations.

    Usines clandestines et commerce de composants chimiques.

    Connexions avec d'autres formes de criminalité (trafic d'organes, drogues, armes).

    Chapitre 6 – Outils analytiques de détection en laboratoire

    Méthodes de contrôle qualité : TLC, HPLC, UV, spectroscopie, spectrométrie de masse.

    Utilisation des dispositifs portatifs sur le terrain (Raman, NIR, Minilab).

    Protocoles d’échantillonnage, conservation, documentation.

    Chapitre 7 – Impact sanitaire et toxicologique des médicaments falsifiés

    Intoxications, décès, résistances antimicrobiennes.

    Cas concrets : faux antipaludiques, insulines, vaccins.

    Répercussions sur les systèmes de santé publique.

    Chapitre 8 – Investigations criminalistiques et médico-légales

    Prélèvements, saisies, conditionnement des preuves pharmaceutiques.

    Analyse comparative (produit suspect vs produit original).

    Rédaction de rapports d’expertise médico-légale.

    Chapitre 9 – Lutte contre la criminalité pharmaceutique sur le plan juridique

    Textes de loi et qualifications pénales.

    Responsabilité civile, administrative et pénale.

    Jurisprudences et exemples de sanctions.

    Chapitre 10 – Réglementations nationales et internationales

    Cadres juridiques OMS, OMC, OMPI, EMA, FDA.

    Directives européennes (ex. : sérialisation).

    Harmonisation des lois entre pays (coopération transfrontalière).

    Chapitre 11 – Interventions des agences spécialisées et opérations internationales

    Présentation d’agences : OMS, Interpol, ONUDC, Europol, DGCCRF.

    Opérations marquantes : Pangea, GPHF, Rapid Alert System.

    Limites et obstacles dans la lutte à l’échelle mondiale.

    Chapitre 12 – Criminalité pharmaceutique et cybercriminalité

    Vente de médicaments sur le dark web.

    Réseaux sociaux, pharmacies en ligne illégales.

    Outils numériques de traçabilité (blockchain, e-prescription, QR codes).

    Chapitre 13 – Technologies et innovations de sécurisation des médicaments

    Techniques anti-contrefaçon : hologrammes, numéros de série, RFID.

    Sérialisation et traçabilité logistique.

    Plateformes d’authentification pour professionnels et consommateurs.

    Chapitre 14 – Prévention, sensibilisation et rôle des professionnels de santé (3h)

    Éducation des prescripteurs et pharmaciens.

    Campagnes de sensibilisation auprès des patients.

    Signalement des produits suspects.

    Chapitre 15 – Études de cas, simulations et exercices pratiques (3h)

    Études de cas : faux antituberculeux, affaire Avastin, sirops pédiatriques toxiques.

    Simulation d’analyse d’un produit suspect.

    Élaboration d’un plan de lutte intégré dans un pays fictif.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  3. Expertise des Traces Physiques : Empreintes, Balistique & Micro traces
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

    Explorer la matière
    S5
    Expertise des Traces Physiques : Empreintes, Balistique & Micro traces

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Biologie, chimie, physique, droit et science forensique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module a pour objectif de former les apprenants aux principes, méthodes et enjeux de l’analyse des traces physiques dans un contexte criminalistique : empreintes digitales, balistique et micro-traces (fibres, verre, peinture, etc.)

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 – Introduction à la trace en criminalistique

    Définition de la trace (selon Locard) : concept et typologie.

    Valeur scientifique et judiciaire des traces.

    Chaîne de custodie, conservation, transport.

    Notion d’intelligence criminelle basée sur les traces.

    Chapitre 2 – Scène de crime et gestion des traces physiques

    Sécurisation et balisage d’une scène.

    Stratégie de recherche des traces visibles et latentes.

    Plan de prélèvement, documentation photographique.

    Matériel de prélèvement : kits, gants, lumière forensique.

    Chapitre 3 – Introduction à l'expertise dactyloscopique

    Historique de l’identification par empreintes digitales.

    Anatomie et formation des crêtes papillaires.

    Types d’empreintes : latentes, moulées, visibles.

    Classification des empreintes (Galton, Vucetich).

    Chapitre 4 – Techniques de relevé et de révélation des empreintes

    Poudres révélatrices (noires, magnétiques, fluorescentes).

    Fumigation cyanoacrylate, ninhydrine, DFO, IND.

    Techniques modernes : VMD, laser, lumière alternative.

    Cas pratique : révélation d’empreintes sur différentes surfaces.

    Chapitre 5 – Analyse et comparaison des empreintes digitales

    Caractéristiques : delta, bifurcations, terminaisons. Distinguer le delta, caractéristique du motif, des minuties locales telles que bifurcations et terminaisons.

    Méthode ACE-V (analyse, comparaison, évaluation, vérification).

    Erreurs possibles et biais cognitifs.

    Bases de données automatisées (AFIS, EURODAC).

    Chapitre 6 – Notions de balistique : fondements et typologie

    Balistique interne, externe, terminale.

    Armes à feu : catégories, fonctionnement, types de projectiles.

    Principes physiques : énergie cinétique, trajectoire.

    Terminologie : ogives, douilles, percussion, rayures.

    Chapitre 7 – Balistique forensique : traces et marques balistiques

    Marquage du projectile par l’arme (rayures, stries).

    Traces sur la douille (percuteur, extracteur).

    Comparaison sous microscope balistique.

    Fiches balistiques et banques de données (IBIS).

    Chapitre 8 – Scène de crime et tir : interprétation et reconstitution

    Tirs à bout touchant, à distance, en angle.

    Analyse des trajectoires et projections.

    Rôle des taches de sang en appui de la balistique.

    Études de cas : meurtres, fusillades, suicides simulés.

    Chapitre 9 – Résidus de tir (GSR) : détection et interprétation

    Composition des résidus conventionnels mentionnés : plomb, baryum, antimoine.

    Prélèvements : tampons, adhésifs, coton.

    Analyse au MEB-EDX, spectrométrie.

    Valeur probante, délais de détection.

    Chapitre 10 – Introduction aux micro-traces : concepts et classification

    Définition et intérêt criminalistique.

    Microfibres, éclats de verre, peintures, terre, pollen, etc.

    Transport primaire/secondaire, persistance, transfert.

    Traces associatives vs traces indicatives.

    Chapitre 11 – Fibres textiles : prélèvement et analyse comparative

    Types de fibres : naturelles, artificielles, synthétiques.

    Techniques d’analyse : microscope polarisant, IRTF, microspectrométrie UV-Vis.

    Rédaction d’un rapport comparatif.

    Études de cas : enlèvements, agressions.

    Chapitre 12 – Traces de verre, peinture et plastiques

    Caractéristiques physiques et chimiques du verre.

    Fractures et reconstitution (fractographie).

    Peintures automobiles : couches, pigments, analyse par GC-MS.

    Identification des plastiques : pyrolyse, spectroscopie.

    Chapitre 13 – Traces de semelles, chaussures et pneus

    Types de traces : positives, négatives, tridimensionnelles.

    Techniques de relevé : moulage, gélatine, électrostatique.

    Bases de données (SICAR, SoleMate).

    Comparaison manuelle et assistée par logiciel.

    Chapitre 14 – Exploitation des traces dans l'enquête judiciaire

    Corrélation entre traces physiques et hypothèse de crime.

    Poids probatoire, pertinence, spécificité.

    Communication avec magistrats, avocats, enquêteurs.

    Rédaction du rapport d’expertise.

    Chapitre 15 – Études de cas, simulations et erreurs d’interprétation

    Études célèbres d’empreintes ou de balistique (ex : Madrid bombing).

    Faux positifs, faux négatifs, erreurs humaines.

    Démonstrations pratiques, résolution de scènes simulées.

    Réflexion éthique et scientifique sur la fiabilité.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  4. Cybercriminalité
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S5
    Cybercriminalité

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Informatique de base, Sécurité informatique, Réseaux informatiques, Analyse des données, Éthique en informatique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L’enseignement de la criminologie générale classique s’avère insuffisant au regard du développement de la technologie en ces temps modernes. L’internet est venu donner un moyen sophistiqué au criminel du savoir ou usant de celui-ci à des fins criminelles. La cybercriminalité est ainsi apparue avec une bonne longueur d’avance sur les pouvoirs judiciaires. Et l’objectif de l’enseignement de cette matière est de doter le criminologue et le criminologiste d’une formation spécialisée dans cette lutte contre le fait cybercriminel.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction à la cybercriminalité

    Définitions et concepts de base

    Historique et évolution de la cybercriminalité

    Cadre juridique et réglementaire

    Loi sur la cybercriminalité et réglementations internationales

    Juridictions et compétences dans les affaires de cybercriminalité

    Responsabilités légales des individus, des entreprises et des gouvernements

    Techniques de piratage informatique

    Ingénierie sociale

    Logiciels malveillants (malware) : virus, vers, chevaux de Troie, ransomwares, etc.

    Attaques par déni de service (DDoS)

    Exploitation de vulnérabilités

    Méthodes d'enquête et de lutte contre la cybercriminalité

    Collecte et préservation des preuves numériques

    Analyse forensique informatique

    Collaboration entre les forces de l'ordre, les agences gouvernementales et les entreprises privées

    Coopération internationale dans les enquêtes sur la cybercriminalité

    Risques et menaces liés à la cybercriminalité

    Vol d'identité et fraude en ligne

    Espionnage industriel et cyberespionnage

    Cyberterrorisme et guerre cybernétique

    Attaques contre l'infrastructure critique (énergie, finance, santé, etc.)

    Protection et prévention

    Sécurité des réseaux informatiques

    Sécurité des données et des systèmes d'information

    Bonnes pratiques en matière de cybersécurité pour les individus, les entreprises et les organisations gouvernementales

    Sensibilisation à la sécurité et formation des utilisateurs

    Éthique et questions morales

    Impacts sociaux et éthiques de la cybercriminalité

    Responsabilité des professionnels de la sécurité informatique

    Débats sur la vie privée, la surveillance et la liberté d'expression en ligne

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 100 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  5. Atelier Biologie Forensique (04)
    5 créditsCoefficient 3Volume semestriel: 60h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 04h00Autres heures: 60h00

    Évaluation: contrôle continu 60% · examen 40%

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    S5
    Atelier Biologie Forensique (04)

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Notions en biologie moléculaire, chimie analytique, et manipulation des indices en contexte forensique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Acquérir les bases pratiques de l’analyse des traces physiques (empreintes, micro-traces, balistique) et de la criminalité pharmaceutique, en lien avec l’identification, la traçabilité et l’authentification des preuves.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier1 — Étude des empreintes digitales et génétiques

    Atelier 2 — Recherche et interprétation de micro-traces biologiques associées

    Atelier 3 — Micro-traces et balistique (Initiation)

    Atelier 4 — Criminalité pharmaceutique : identification de contrefaçons

    Atelier 5 — Traçabilité et authentification de produits pharmaceutiques

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Compte rendu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc
  6. Atelier de Génétique moléculaire des pathologies humaine
    4 créditsCoefficient 2Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: -TD / semaine: -TP / semaine: 03h00Autres heures: 50h00

    Évaluation: contrôle continu - · examen 100%

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    S5
    Atelier de Génétique moléculaire des pathologies humaine

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Des connaissances en biologie moléculaire et en génétique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    L'objectif de cet atelier est de familiariser les étudiants avec diverses techniques fondamentales de biologie moléculaire, en particulier celles basées sur la réaction de polymérisation en chaîne (PCR), telles que la PCR-RFLP, la PCR multiplex et la PCR allèle spécifique. L’atelier abordera également plusieurs applications pratiques de ces techniques chez les eucaryotes, notamment pour le diagnostic des maladies héréditaires, la détection de polymorphismes génétiques et l’établissement de liens de parenté.

    Programme

    Contenu de la matière

    Atelier 1 : Extraction de l’ADN génomique humain (technique salting-out ou avec Kit)

    Atelier 2 : Tests quantitatifs et qualitatifs des ADN extraits

    Atelier 3 : PCR Allèle Spécifique

    Atelier 4 : PCR -RFLP

    Atelier 5 : PCR Multiplex

    Atelier 6 : PCR-SSCP

    Atelier 7 : qPCR

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Compte rendu : 60 % ; Examen : 40 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc
  7. Psychologie criminelle
    2 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 45h00
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: 01h30TP / semaine: -Autres heures: 25h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S5
    Psychologie criminelle

    Repères

    Connaissances préalables recommandée

    Des connaissances en Psychologie

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Comprendre les motivations, les comportements et les facteurs psychologiques sous-jacents au comportement criminel, ainsi que développer des stratégies pour prévenir la criminalité et réhabiliter les délinquants.

    Programme

    Contenu de la matière

    Introduction à la psychologie criminelle

    Définitions et domaines d'étude

    Historique de la psychologie criminelle

    Importance et applications pratiques

    Théories de la criminalité

    Théories biologiques

    Théories psychologiques (psychodynamiques, cognitives, sociales)

    Théories sociologiques

    Approches intégratives

    Facteurs psychologiques du comportement criminel

    Troubles mentaux et criminels

    Psychopathie et comportement antisocial

    Développement de la délinquance

    Méthodes de recherche en psychologie criminelle

    Études longitudinales et transversales

    Méthodes d'observation et d'entrevue

    Techniques d'évaluation psychologique

    Profilage criminel

    Techniques de profilage

    Cas d'étude et applications pratiques

    Interventions psychologiques

    Thérapies cognitivo- comportementales

    Programmes de réhabilitation des délinquants

    Prévention de la récidive

    Éthique et professionnalisme en psychologie criminelle

    Normes éthiques dans la pratique

    Responsabilités professionnelles

    Limites et controverses

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc
  8. Ingénierie inversée
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 15h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S5
    Ingénierie inversée

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Notions de biologie moléculaire, génétique, biochimie et bases en informatique scientifique.

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Ce module initie les étudiants aux principes fondamentaux du reverse engineering appliqué aux sciences du vivant, en mettant l'accent sur la compréhension et la reconstruction des systèmes biologiques complexes. Il couvre les notions de rétro-ingénierie technologique, les niveaux de maturité technologique (TRL), ainsi que les enjeux juridiques liés à la propriété intellectuelle. Les étudiants acquerront également des compétences pratiques en bioinformatique, en modélisation de réseaux biologiques, et en ingénierie de constructions génétiques. L'objectif est de former des biologistes capables de concevoir, simuler et optimiser des systèmes biologiques à l’aide d’approches intégrées et innovantes.

    Programme

    Contenu de la matière
    Chapitre 1 : Principes et enjeux du Reverse Engineering en sciences du vivant

    Concepts fondamentaux du Reverse Engineering

    Définition et historique

    Origine du concept en ingénierie mécanique, électronique, puis adaptation aux sciences du vivant.

    Importance du RE dans la biologie moderne : comprendre, améliorer, reproduire.

    Différences entre Reverse Engineering et Forward Engineering

    Forward Engineering : processus de conception linéaire (de l'idée au produit).

    Reverse Engineering : partir d'un produit existant pour en déduire la conception.

    Applications industrielles

    Maintenance et amélioration d'appareillages biologiques (PCR, séquenceurs).

    Innovation compétitive : bio-impression, création d'outils diagnostics alternatifs.

    Interopérabilité : compatibilité entre instruments, logiciels et bases de données.

    Échelle TRL (Technology Readiness Level)

    Présentation des 9 niveaux TRL

    TRL 1 : Observation scientifique de base.

    TRL 5 : Validation technologique en environnement pertinent.

    TRL 9 : Système validé en environnement opérationnel.

    Positionnement d’un projet biologique selon les TRL

    Exemples : développement d’un test PCR rapide, production de vaccins expérimentaux.

    Les moyens nécessaires pour franchir les TRL

    Ressources humaines, matérielles, financières.

    Planification des essais pilotes et pré-industriels.

    Cadre juridique et propriété intellectuelle

    Le droit à l’ingénierie inverse face aux brevets

    Principe du fair use, DMCA, directives européennes.

    Analyse comparative internationale

    Tableau résumé :

    Pays

    Autorisation du RE

    Restrictions principales

    USA

    Oui

    Clauses contractuelles, DMCA

    UE

    Limité

    Directives sur les logiciels

    Gestion des risques juridiques

    Rédaction de contrats clairs, clauses spécifiques RE, protections anti-contournement.

    Limites légales

    RE autorisé pour analyse et interopérabilité ; interdit pour copie/revente non autorisée.

    Chapitre 2 : Approches intégrées de rétro-ingénierie, bioinformatique et modélisation des systèmes biologiques

    Reverse Engineering des Systèmes Biologiques

    Approche de déconstruction biologique

    Décomposition de réseaux métaboliques et voies de signalisation.

    Reconstruction fonctionnelle à partir de données expérimentales.

    Exemples concrets

    Réseaux de réponse au stress oxydatif.

    Mécanismes moléculaires de l'apoptose.

    Bioinformatique et Logiciels Libres en Sciences Biologiques

    Introduction aux logiciels open-source

    Biopython, RStudio, Galaxy pour bioanalyse.

    Ateliers pratiques

    Annotation génomique libre avec GenomeTools.

    Analyse de séquences de gènes cibles avec FastQC et Clustal Omega.

    Modélisation et Simulation en Biologie

    Outils de simulation libre

    COPASI pour la dynamique des systèmes biochimiques.

    CellDesigner pour modéliser les réseaux de signalisation.

    Mini-projets

    Simulation de la dynamique d'un réseau d'inflammation.

    Optimisation d’une voie métabolique via un modèle dynamique.

    Reverse Engineering des analyses biologiques forensiques

    Étude de kits ADN commerciaux et open source (STRait Razor).

    Outils libres pour l’interprétation de profils ADN (Arlequin, STRUCTURE).

    Atelier

    Reconstruction d’une scène de crime virtuelle avec des outils libres.

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.
  9. English for Biologists – Advanced
    1 créditsCoefficient 1Volume semestriel: 22h30
    Cours / semaine: 01h30TD / semaine: -TP / semaine: -Autres heures: 5h00

    Évaluation: contrôle continu 40% · examen 60%

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    S5
    English for Biologists – Advanced

    Repères

    Connaissances préalables recommandées

    Connaissances de base en anglais

    Objectifs

    Objectifs de l’enseignement

    Cette matière développe les compétences des étudiants en communication écrite et orale en anglais.

    Programme

    Contenu de la matière

    Unité 1 : Règles fondamentales de rédaction des manuscrits scientifiques

    - Vue d’ensemble de la langue des manuscrits scientifiques

    - Temps verbaux

    - Grammaire

    - Phrases

    - Paragraphes

    Unité 2 : Erreurs fréquentes à éviter dans la rédaction d’un manuscrit

    Unité 3 : Soutenance de thèse

    - Qu’est-ce qu’une soutenance de thèse ?

    - Comment commencer sa présentation ?

    - Formuler la problématique et les objectifs de recherche

    - Décrire les méthodes

    - Décrire et discuter les résultats

    - Conclusion et perspectives

    - Travailler les transitions

    - Comment conclure sa présentation ?

    Unité 4 : Après le diplôme, quelle suite ?

    - Définir ses objectifs professionnels

    - Préparer un entretien d’embauche

    - Rédiger son CV

    - Rédiger une lettre de motivation

    - Présenter une candidature à une bourse

    Évaluation

    Mode d’évaluation : Contrôle continu : 40 % ; Examen : 60 %.

    Références

    Références : Livres et polycopiés, sites internet, etc.

    Projet de fin d’études

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Semestre 61 matière
  1. Projet de Fin d’Etudes
    30 créditsCoefficient 17Volume semestriel: 750
    Cours / semaine: 75TD / semaine: 225TP / semaine: 450Autres heures: -

    Évaluation: contrôle continu 50 % · examen 50 %

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    S6
    Projet de Fin d’Etudes

    Objectifs

    Objectifs du projet :

    Les objectifs du projet de fin d’études sont de préparer les étudiants à s'adapter à l'environnement de la recherche et à comprendre comment les projets sont exécutés dans un laboratoire. Il permettra également aux étudiants d'apprendre les aspects pratiques de la Biologie Moléculaire et de former les étudiants à l'art de l'analyse et de la rédaction de thèses.

    Résultats d'apprentissage des étudiants :

    Les étudiants devraient être capables d'apprendre comment sélectionner et défendre un sujet de leur recherche, comment planifier, exécuter, évaluer et discuter efficacement leurs expériences. Les étudiants devraient être en mesure de démontrer une amélioration considérable dans les domaines suivants :

    • Connaissance approfondie du domaine de recherche choisi.

    • Capacité à intégrer de manière critique et systématique les connaissances pour identifier les problèmes qui doivent être traités dans le cadre d'une thèse spécifique.

    • Compétence dans la conception et la planification de la recherche.

    • Capacité à créer, analyser et évaluer de manière critique différentes solutions techniques.

    • Capacité à mener des recherches de manière indépendante.

    • Aptitude à appliquer des techniques analytiques/méthodes expérimentales.

    • Compétences en gestion de projet.

    • Compétences en rédaction de rapports.

    • Des talents pour la résolution des problèmes.

    • Compétences en communication et relations interpersonnelles.

    Programme

    Démarche méthodologique

    Planification et réalisation d'expériences

    Sur la base de la proposition de projet soumise au semestre précédent, les étudiants devraient être capables de, planifier et de s'engager dans une enquête critique indépendante, un projet de fin d’études en sciences biologiques criminalistiques. Ils devraient être en mesure d'identifier systématiquement la théorie et les concepts pertinents, de les relier aux méthodologies et aux preuves appropriées, d'appliquer les techniques appropriées et de tirer les conclusions appropriées. Les étudiants doivent être en mesure de travailler de manière indépendante et soient capables de comprendre le but de chaque expérience qu'ils réalisent. Ils devraient également être en mesure de comprendre les résultats possibles de chaque expérience.

    Rédaction du manuscrit

    À la fin de leur projet, un mémoire de fin d’étude doit être rédigé donnant tous les détails tels que l'objectif, la méthodologie, les résultats, la discussion et les travaux futurs liés à leur projet. Les étudiants peuvent viser à faire publier leurs résultats de recherche dans une revue à comité de lecture. Si les résultats de la recherche ont des résultats orientés vers l'application, les étudiants peuvent déposer une demande de brevet.

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